RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372146.4

GTF3C4-201, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTF3C4, Length 9,043 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4-201ENST00000372146 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 SLC38A3Q99624 504 aa14.67□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 FBXO24O75426 580 aa14.67□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 STATHP02808 62 aa14.67□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 G6PDP11413 515 aa14.67□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 MYF6P23409 242 aa14.67□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 GIFP27352 417 aa14.67□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 STRADAQ7RTN6 431 aa14.67□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 TMEM150AQ86TG1 271 aa14.67□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 A8MUA0 341 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 INHAP05111 366 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 KCNC1P48547 511 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 KCNC4Q03721 635 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 SLAMF1Q13291 335 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 PHYHD1Q5SRE7 291 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 PIP5K1AQ99755 562 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 GON7Q9BXV9 100 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 PTPRMP28827 1452 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 A0A0B4J2A0 478 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 GRXCR2A6NFK2 248 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 ARHGAP19Q14CB8 494 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 GPR19Q15760 415 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 LRRC73Q5JTD7 316 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 CARD17Q5XLA6 110 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 SMYD5Q6GMV2 418 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 SHPKQ9UHJ6 478 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 A8MU76 341 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 ADAM12O43184 909 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 CSF1P09603 554 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 GP1BBP13224 206 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 TSFMP43897 325 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 TPMTP51580 245 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 HYAL2Q12891 473 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 GINS1Q14691 196 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 DBX2Q6ZNG2 339 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 C14orf80Q86SX3 495 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 PLA2G15Q8NCC3 412 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 SLC25A51Q9H1U9 297 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 ALPPL2P10696 532 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 HTR7P34969 479 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 ARRDC4Q8NCT1 418 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 CPN1P15169 458 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 DECR1Q16698 335 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 SFRP5Q5T4F7 317 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 FJX1Q86VR8 437 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 DNAJA3Q96EY1 480 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 C10orf90Q96M02 699 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 DCAF16Q9NXF7 216 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 SLC22A14Q9Y267 594 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 UNC119BA6NIH7 251 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 ACTL6BO94805 426 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 F7P08709 466 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 MAKP20794 623 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 TSTD2Q5T7W7 516 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 FRG2Q64ET8 278 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 PIM3Q86V86 326 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 JOSD2Q8TAC2 188 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 FRG2BQ96QU4 278 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 NUDT9Q9BW91 350 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 RDH16O75452 317 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 AKAIN1P0CW23 69 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 ABHD11Q8NFV4 315 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 OR51T1Q8NGJ9 327 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 ASB6Q9NWX5 421 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 TMEM150CB9EJG8 249 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 CLDN11O75508 207 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 PMPCAQ10713 525 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 TAF9Q16594 264 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 HIST2H3AQ71DI3 136 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 RDH10Q8IZV5 341 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 IQSEC2Q5JU85 1478 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 H3BUI4 141 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 SULT1C4O75897 302 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 C6orf47O95873 294 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 PPP3CBP16298 524 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 PYCR1P32322 319 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 PLGLB1Q02325 96 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 LCN10Q6JVE6 187 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF3C4-201ENST00000372146 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms