RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365488.1

RNU6-652P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 652, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-652P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-652P-201ENST00000365488 P2RY4P51582 365 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 CAV2P51636 162 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 ZNF75DP51815 510 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 ARHGDIBP52566 201 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 SLC7A2P52569 658 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 NAGLUP54802 743 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 MFAP2P55001 183 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 LIM2P55344 173 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 NOP14P78316 857 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 MC1RQ01726 317 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 IL10RBQ08334 325 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 CD47Q08722 323 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 STK4Q13043 487 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 SLAQ13239 276 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 GIT2Q14161 759 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 GCKRQ14397 625 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 KCNJ11Q14654 390 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 C16orf72Q14CZ0 275 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 RPS6KA1Q15418 735 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 SPHARQ15513 63 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 OR1C1Q15619 314 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 MAPK11Q15759 364 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 RBBP7Q16576 425 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 MEA1Q16626 185 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 ECSCRQ19T08 205 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 LRRC36Q1X8D7 754 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 QRICH1Q2TAL8 776 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 HKDC1Q2TB90 917 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 WSCD2Q2TBF2 565 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 DEFB116Q30KQ4 102 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 ARMCX4Q5H9R4 360 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 MS4A13Q5J8X5 152 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 TMEM255AQ5JRV8 349 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 SPIN3Q5JUX0 258 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 TTC27Q6P3X3 843 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 FUT10Q6P4F1 479 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 ATRAIDQ6UW56 229 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 C16orf54Q6UWD8 224 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 MFSD7Q6UXD7 560 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 WASH2PQ6VEQ5 465 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 C17orf107Q6ZR85 190 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 OTOAQ7RTW8 1153 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 FAM220AQ7Z4H9 259 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 HMGN2P46Q86SG4 172 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 ANKRD46Q86W74 232 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 CREBRFQ8IUR6 639 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 C12orf56Q8IXR9 622 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 FTMTQ8N4E7 242 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 BBS1Q8NFJ9 593 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 BEST4Q8NFU0 473 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 OR10G2Q8NGC3 310 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 OR6J1Q8NGC5 347 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 OR2A12Q8NGT7 310 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 OR4L1Q8NH43 312 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 NCOA7Q8NI08 942 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 VN1R17PQ8TDU5 208 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 TEKT4Q8WW24 435 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 FAM151AQ8WW52 585 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 RDH5Q92781 318 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 SPSB1Q96BD6 273 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 PYCR2Q96C36 320 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 EVI5LQ96CN4 794 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 RMI2Q96E14 147 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 DNAJA3Q96EY1 480 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 CCDC34Q96HJ3 373 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 TSSK2Q96PF2 358 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 RAB40CQ96S21 281 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 RASL10BQ96S79 203 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 SEPHS2Q99611 448 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 CCDC106Q9BWC9 280 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 TM2D1Q9BX74 207 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 HCAR1Q9BXC0 346 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 GPR174Q9BXC1 333 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 SLC26A6Q9BXS9 759 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 ULBP2Q9BZM5 246 aa-0.08□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms