RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 C19orf43Q9BQ61 176 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPXQ9BT56 116 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 SIRPDQ9H106 197 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 IL1RL2Q9HB29 575 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 HPS4Q9NQG7 708 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 HOMER3Q9NSC5 361 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 ABCC13Q9NSE7 274 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 KCNN3Q9UGI6 736 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 CIDEBQ9UHD4 219 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP2.14□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 FGD5Q6ZNL6 1462 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 A0A0U1RRA0 63 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM89A2RUT3 159 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 SRRM5B3KS81 715 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 E9PAM4 449 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 K7ERI5 159 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 CYB561D2O14569 222 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 LRRTM2O43300 516 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 BUB1O43683 1085 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 PROS1P07225 676 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 GSTA1P08263 222 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 MELTFP08582 738 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 GNSP15586 552 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 UCP1P25874 307 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMOD1P28289 359 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 ELK3P41970 407 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAGEA4P43358 317 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 BRCC3P46736 316 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 NPY2RP49146 381 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 RPL34P49207 117 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 NUMBP49757 651 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF131P52739 623 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 MFAP2P55001 183 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 CRMP1Q14194 572 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 C14orf28Q4W4Y0 310 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 EIPR1Q53HC9 387 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 NHLRC3Q5JS37 347 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 ACER2Q5QJU3 275 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 RAB12Q6IQ22 244 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 C1orf186Q6ZWK4 172 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 TAF8Q7Z7C8 310 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 ERC1Q8IUD2 1116 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC39A11Q8N1S5 342 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 PYROXD2Q8N2H3 581 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 FGFRL1Q8N441 504 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARL14Q8N4G2 192 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 LRRC17Q8N6Y2 441 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF491Q8N8L2 437 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARL10Q8N8L6 244 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 SUMF1Q8NBK3 374 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM37Q8WXS4 190 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 P3H4Q92791 437 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM45BQ96B21 275 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 BIRC7Q96CA5 298 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 NSMCE2Q96MF7 247 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 FOXN4Q96NZ1 517 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 DEFB118Q96PH6 123 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 CPXM1Q96SM3 734 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 COQ7Q99807 217 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 FTHL17Q9BXU8 183 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 NACA2Q9H009 215 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 AMBNQ9NP70 447 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 IKZF3Q9UKT9 509 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 DNPEPQ9ULA0 475 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCPG1Q9ULG6 757 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF175Q9Y473 711 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 A0A0A6YYD4 124 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 CFAP73A6NFT4 308 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 CYSRT1A8MQ03 144 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF487B1APH4 448 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 GPRIN2O60269 458 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 KBTBD11O94819 623 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 NUDT14O95848 222 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 GOT2P00505 430 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 PGK2P07205 417 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM200BP0CF97 657 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 BCL3P20749 454 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRIM23P36406 574 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 MYBPC1Q00872 1141 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 C17orf58Q2M2W7 97 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 C15orf32Q32M92 178 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 AGKQ53H12 422 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 IL23RQ5VWK5 629 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 LIPKQ5VXJ0 399 aa2.12□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms