RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 ZER1Q7Z7L7 766 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 PDZD3Q86UT5 571 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 SLC51AQ86UW1 340 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 CMIPQ8IY22 773 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 DNAAF1Q8NEP3 725 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 MARVELD3Q96A59 401 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 FZD8Q9H461 694 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 ENAMQ9NRM1 1142 aa4.7□□□□□ -1.66
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PTPRD-201ENST00000355233 KCNG2Q9UJ96 466 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 LTBP4Q8N2S1 1624 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 M0QZK8 103 aa4.7□□□□□ -1.66
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PTPRD-201ENST00000355233 PCDH7O60245 1069 aa4.7□□□□□ -1.66
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PTPRD-201ENST00000355233 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 DCAF7P61962 342 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 TLE4Q04727 773 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF266Q14584 549 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 DECR1Q16698 335 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 CYBRD1Q53TN4 286 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 ARSHQ5FYA8 562 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 SLC39A4Q6P5W5 647 aa4.7□□□□□ -1.66
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PTPRD-201ENST00000355233 ENPP7Q6UWV6 458 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 BEST3Q8N1M1 668 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 CADM2Q8N3J6 435 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM156Q8N614 296 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM145Q8NBT3 493 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 CORO2AQ92828 525 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 ALPK1Q96QP1 1244 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 PDZD7Q9H5P4 517 aa4.7□□□□□ -1.66
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PTPRD-201ENST00000355233 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa4.7□□□□□ -1.66
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PTPRD-201ENST00000355233 RAD51DO75771 328 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 OR2F2O95006 317 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 UGT2B7P16662 529 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 MTNR1AP48039 350 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP4.7□□□□□ -1.66
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PTPRD-201ENST00000355233 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 COQ8BQ96D53 544 aa4.7□□□□□ -1.66
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