RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 CDKN2DP55273 166 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 HSF2Q03933 536 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 FOLH1Q04609 750 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 NPRL3Q12980 569 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 SPIN4Q56A73 249 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 HMBOX1Q6NT76 420 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 C1orf94Q6P1W5 598 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 RTL4Q6ZR62 310 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC121Q6ZUS5 278 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 LANCL3Q6ZV70 420 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 BEST3Q8N1M1 668 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 MFSD9Q8NBP5 474 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP4.17□□□□□ -1.746e-8■■■■■ 31.9
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PTPRC-201ENST00000348564 TADA1Q96BN2 335 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF607Q96SK3 696 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 CDADC1Q9BWV3 514 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 OR52A5Q9H2C5 316 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 PLAC1Q9HBJ0 212 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 UBAP1Q9NZ09 502 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 WDR45Q9Y484 360 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 MMACHCQ9Y4U1 282 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 SLC5A10A0PJK1 596 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 ERICH4A6NGS2 130 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP4.17□□□□□ -1.74
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PTPRC-201ENST00000348564 PEX14O75381 377 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 NSA2O95478 260 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 MT-ND5P03915 603 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 ENO1P06733 434 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 GIMD1P0DJR0 217 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 PRPS2P11908 318 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 IMPA1P29218 277 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 CSF2RBP32927 897 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 PIGAP37287 484 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 MEOX1P50221 254 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 SEC24CP53992 1094 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 RAB38P57729 211 aa4.17□□□□□ -1.74
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PTPRC-201ENST00000348564 LIPMQ5VYY2 423 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 CD163Q86VB7 1156 aa4.17□□□□□ -1.74
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PTPRC-201ENST00000348564 C12orf49Q9H741 205 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 CALHM2Q9HA72 323 aa4.17□□□□□ -1.74
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PTPRC-201ENST00000348564 TAS2R10Q9NYW0 307 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 SLC17A7Q9P2U7 560 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 RIMKLBQ9ULI2 386 aa4.17□□□□□ -1.74
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PTPRC-201ENST00000348564 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 TSPAN11A1L157 253 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 C9orf172C9J069 976 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 MYO1CO00159 1063 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 XKRYO14609 159 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 TM9SF1O15321 606 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 ZG16O60844 167 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 CTNSO60931 367 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 BAG2O95816 211 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 SAGP10523 405 aaPredicted RBP4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 CBLP22681 906 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 ARNTP27540 789 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 ACADLP28330 430 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 GMPRP36959 345 aa4.16□□□□□ -1.74
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PTPRC-201ENST00000348564 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
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PTPRC-201ENST00000348564 FAM91A1Q658Y4 838 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM107Q6UX40 140 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 XKR5Q6UX68 686 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 CATSPER1Q8NEC5 780 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 ACMSDQ8TDX5 336 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 DUSP19Q8WTR2 217 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 SPDL1Q96EA4 605 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM216Q9P0N5 145 aa4.16□□□□□ -1.74
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