RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 FRKP42685 505 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 MANFP55145 182 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 MLF1P58340 268 aa24.86■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF385BQ569K4 471 aa24.86■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF628Q5EBL2 1059 aa24.86■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 FCRLBQ6BAA4 426 aa24.86■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 SLC29A4Q7RTT9 530 aa24.86■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 OR9A2Q8NGT5 310 aa24.86■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 NUBPLQ8TB37 319 aa24.86■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 HAS2Q92819 552 aa24.86■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 RNF32Q9H0A6 362 aa24.86■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 CFL2Q9Y281 166 aa24.86■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 GPR45Q9Y5Y3 372 aa24.86■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 SSTR4P31391 388 aa24.86■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 LTB4RQ15722 352 aa24.86■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 CAMKMTQ7Z624 323 aa24.86■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF615Q8N8J6 731 aa24.86■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 MYOTQ9UBF9 498 aa24.86■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 ANKRD28O15084 1053 aa24.85■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 PLOD3O60568 738 aa24.85■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 IFI6P09912 130 aa24.85■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP24.85■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 LAMP1P11279 417 aa24.85■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 MLC1Q15049 377 aa24.85■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 MPEG1Q2M385 716 aa24.85■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 DPY19L1Q2PZI1 675 aa24.85■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 KAT2AQ92830 837 aa24.85■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 TESCQ96BS2 214 aa24.85■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 NPAS2Q99743 824 aa24.85■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 EBF4Q9BQW3 602 aa24.85■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 NPHS2Q9NP85 383 aa24.85■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa24.85■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 BCAP29Q9UHQ4 241 aa24.85■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 COL6A6A6NMZ7 2263 aa24.84■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 CHD6Q8TD26 2715 aa24.84■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 A0A087WV62 115 aa24.84■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 PLOD2O00469 737 aa24.84■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 CLPSP04118 112 aa24.84■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 ARG2P78540 354 aa24.84■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 PGS1Q32NB8 556 aa24.84■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 C9orf40Q8IXQ3 194 aa24.84■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 BEST3Q8N1M1 668 aa24.84■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 TEX19Q8NA77 164 aa24.84■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 DUSP26Q9BV47 211 aa24.84■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 SLAMF7Q9NQ25 335 aa24.84■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 PRODH2Q9UF12 536 aa24.84■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 A0A1W2PRB8 838 aa24.83■■□□□ 1.56
CRIP1-201ENST00000330233 TMEM200CA6NKL6 621 aa24.83■■□□□ 1.56
CRIP1-201ENST00000330233 PRAMEF2O60811 474 aa24.83■■□□□ 1.56
CRIP1-201ENST00000330233 WDPCPO95876 746 aa24.83■■□□□ 1.56
CRIP1-201ENST00000330233 PTGER1P34995 402 aa24.83■■□□□ 1.56
CRIP1-201ENST00000330233 SOX18P35713 384 aa24.83■■□□□ 1.56
CRIP1-201ENST00000330233 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.56
CRIP1-201ENST00000330233 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.56
CRIP1-201ENST00000330233 KLRB1Q12918 225 aa24.83■■□□□ 1.56
CRIP1-201ENST00000330233 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.56
CRIP1-201ENST00000330233 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa24.83■■□□□ 1.56
CRIP1-201ENST00000330233 TMEM198Q66K66 360 aa24.83■■□□□ 1.56
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.56
CRIP1-201ENST00000330233 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.56
CRIP1-201ENST00000330233 OR8J2Q8NGG1 315 aa24.83■■□□□ 1.56
CRIP1-201ENST00000330233 ELP4Q96EB1 424 aa24.83■■□□□ 1.56
CRIP1-201ENST00000330233 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.56
CRIP1-201ENST00000330233 ZBTB18Q99592 522 aa24.83■■□□□ 1.56
CRIP1-201ENST00000330233 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.56
CRIP1-201ENST00000330233 DCTN4Q9UJW0 460 aa24.83■■□□□ 1.56
CRIP1-201ENST00000330233 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa24.82■■□□□ 1.56
CRIP1-201ENST00000330233 MAN1A2O60476 641 aa24.82■■□□□ 1.56
CRIP1-201ENST00000330233 ITGA10O75578 1167 aa24.82■■□□□ 1.56
CRIP1-201ENST00000330233 CBX7O95931 251 aa24.82■■□□□ 1.56
CRIP1-201ENST00000330233 GPC1P35052 558 aa24.82■■□□□ 1.56
CRIP1-201ENST00000330233 UFM1P61960 85 aa24.82■■□□□ 1.56
CRIP1-201ENST00000330233 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
CRIP1-201ENST00000330233 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
CRIP1-201ENST00000330233 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
CRIP1-201ENST00000330233 VPS37AQ8NEZ2 397 aa24.82■■□□□ 1.56
CRIP1-201ENST00000330233 OR52R1Q8NGF1 315 aa24.82■■□□□ 1.56
CRIP1-201ENST00000330233 C16orf52Q8NHV5 167 aa24.82■■□□□ 1.56
CRIP1-201ENST00000330233 RFWD2Q8NHY2 731 aa24.82■■□□□ 1.56
CRIP1-201ENST00000330233 TP53INP1Q96A56 240 aa24.82■■□□□ 1.56
CRIP1-201ENST00000330233 WWTR1Q9GZV5 400 aa24.82■■□□□ 1.56
CRIP1-201ENST00000330233 CLMPQ9H6B4 373 aa24.82■■□□□ 1.56
CRIP1-201ENST00000330233 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
CRIP1-201ENST00000330233 TAS2R9Q9NYW1 312 aa24.82■■□□□ 1.56
CRIP1-201ENST00000330233 PLA2G3Q9NZ20 509 aa24.82■■□□□ 1.56
CRIP1-201ENST00000330233 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
CRIP1-201ENST00000330233 E9PBE3 544 aa24.81■■□□□ 1.56
CRIP1-201ENST00000330233 WWP2O00308 870 aa24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms