RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 MYO7BQ6PIF6 2116 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM233B4DJY2 109 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 NPIPB8E9PQR5 432 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 TFECO14948 347 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 ASNA1O43681 348 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC19A2O60779 497 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 FBXO45P0C2W1 286 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPX3P22352 226 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARRB2P32121 409 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 HSF1Q00613 529 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 RBPJQ06330 500 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAP4K2Q12851 820 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 HEPACAMQ14CZ8 416 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 FJX1Q86VR8 437 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 SIMC1Q8NDZ2 872 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADCY4Q8NFM4 1077 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR2T11Q8NH01 316 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDC26Q8NHZ8 85 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM76AQ8TAV0 307 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP18.04■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 RELTQ969Z4 430 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADIPOR1Q96A54 375 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 CTHRC1Q96CG8 243 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZIM3Q96PE6 472 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 MYNNQ9NPC7 610 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 SACM1LQ9NTJ5 587 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 EHD3Q9NZN3 535 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 GTF3C1Q12789 2109 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A1B0GUH1 482 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 HS6ST1O60243 411 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 CBX7O95931 251 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 BPGMP07738 259 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 CA7P43166 264 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIAA0040Q15053 153 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 CEBPEQ15744 281 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRSS53Q2L4Q9 553 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP18.03■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF628Q5EBL2 1059 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 CMPK2Q5EBM0 449 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 CEP85LQ5SZL2 805 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM71E1Q6IPT2 247 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 GHDCQ8N2G8 530 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF675Q8TD23 568 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 PAQR8Q8TEZ7 354 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 TP53INP1Q96A56 240 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAGED4Q96JG8 741 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 PFDN4Q9NQP4 134 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF835Q9Y2P0 537 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF407Q9C0G0 2248 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC28A1O00337 649 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNHIT1O43257 154 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 FGF4P08620 206 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 NEFHP12036 1026 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 GP1BBP13224 206 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCSK2P16519 638 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 DDCP20711 480 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 CNR1P21554 472 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 DNASE1L1P49184 302 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 C3AR1Q16581 482 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 NOXRED1Q6NXP6 359 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM64Q6YI46 380 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 GK5Q6ZS86 529 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 Q6ZSR9 355 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 FGD2Q7Z6J4 655 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 EXOC3L1Q86VI1 746 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCDC116Q8IYX3 515 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 TAGAPQ8N103 731 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM13CQ8NE31 585 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 C17orf47Q8NEP4 570 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR10G3Q8NGC4 313 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR9A2Q8NGT5 310 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR6Y1Q8NGX8 325 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZBTB9Q96C00 473 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 FCRL1Q96LA6 429 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM173AQ9BQD7 235 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 TTTY12Q9BZ98 90 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRTM1Q9HBL6 345 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 GIMAP4Q9NUV9 329 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.4 ms