RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318978.5

CTXN1-201, Transcript of cortexin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN1, Length 1,274 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1-201ENST00000318978 AGR3Q8TD06 166 aa23.52■■□□□ 1.36
CTXN1-201ENST00000318978 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
CTXN1-201ENST00000318978 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
CTXN1-201ENST00000318978 MIEF1Q9NQG6 463 aa23.52■■□□□ 1.36
CTXN1-201ENST00000318978 DEPPQ9NTK1 212 aa23.52■■□□□ 1.36
CTXN1-201ENST00000318978 MAT2BQ9NZL9 334 aa23.52■■□□□ 1.36
CTXN1-201ENST00000318978 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 POLEQ07864 2286 aa23.51■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP23.51■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 LINC00032P0C843 101 aa23.51■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 RNF224P0DH78 156 aa23.51■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 CNR1P21554 472 aa23.51■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 DUSP2Q05923 314 aa23.51■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 MAP4K2Q12851 820 aa23.51■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 KANK2Q63ZY3 851 aa23.51■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 NOXRED1Q6NXP6 359 aa23.51■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 GK5Q6ZS86 529 aa23.51■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 GHDCQ8N2G8 530 aa23.51■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 OR5M3Q8NGP4 307 aa23.51■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 ZNF681Q96N22 645 aa23.51■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa23.51■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 BBS4Q96RK4 519 aa23.51■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 FAM173AQ9BQD7 235 aa23.51■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 LRTM1Q9HBL6 345 aa23.51■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 TRAF6Q9Y4K3 522 aa23.51■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 A0A0G2JMM0 328 aa23.5■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 A0A1W2PPB8 328 aa23.5■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 A0A1W2PRS3 328 aa23.5■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 KIR3DP1A8MWS1 328 aa23.5■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 HS6ST1O60243 411 aa23.5■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 SLC19A2O60779 497 aa23.5■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 ERLIN1O75477 346 aa23.5■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 LDLRP01130 860 aa23.5■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 BPGMP07738 259 aa23.5■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 MYZAPP0CAP1 466 aa23.5■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 CCL3P10147 92 aa23.5■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 NEFHP12036 1026 aa23.5■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 NRG3P56975 720 aa23.5■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP23.5■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 SH2D4BQ5SQS7 431 aa23.5■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 SLC22A10Q63ZE4 541 aa23.5■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 CROCCP2Q86T23 111 aa23.5■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 NUDCD3Q8IVD9 361 aa23.5■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 HOMEZQ8IX15 550 aa23.5■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 C16orf52Q8NHV5 167 aa23.5■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 TP53INP1Q96A56 240 aa23.5■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa23.5■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 C1orf109Q9NX04 203 aa23.5■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 CFL2Q9Y281 166 aa23.5■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 FAM166BA8MTA8 275 aa23.49■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 CAPN14A8MX76 684 aa23.49■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 TMEM233B4DJY2 109 aa23.49■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 ACOT7O00154 380 aa23.49■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 ABOP16442 354 aa23.49■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 DDCP20711 480 aa23.49■■□□□ 1.35
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CTXN1-201ENST00000318978 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 HSF1Q00613 529 aa23.49■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 TMEM64Q6YI46 380 aa23.49■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 EXOC3L1Q86VI1 746 aa23.49■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 CLYBLQ8N0X4 340 aa23.49■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 OR52R1Q8NGF1 315 aa23.49■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 KCNK9Q9NPC2 374 aa23.49■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 MYNNQ9NPC7 610 aa23.49■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 EHD3Q9NZN3 535 aa23.49■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 CCL27Q9Y4X3 112 aa23.49■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa23.49■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 A1L4Q6 167 aa23.48■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 WDR91A4D1P6 747 aa23.48■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 PINLYPA6NC86 204 aa23.48■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 FBXO45P0C2W1 286 aa23.48■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 PCSK2P16519 638 aa23.48■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 S1PR1P21453 382 aa23.48■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 MPIP34949 423 aa23.48■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 SERPINB5P36952 375 aa23.48■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 MGAT2Q10469 447 aa23.48■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 LYPD8Q6UX82 237 aa23.48■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 TICAM1Q8IUC6 712 aa23.48■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 ZNF441Q8N8Z8 693 aa23.48■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 OR10G3Q8NGC4 313 aa23.48■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 OR9A2Q8NGT5 310 aa23.48■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 TWIST2Q8WVJ9 160 aa23.48■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 KAT2AQ92830 837 aa23.48■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 PKNOX2Q96KN3 472 aa23.48■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 TUBB1Q9H4B7 451 aa23.48■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 PTPN13Q12923 2485 aa23.48■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 GTF3C1Q12789 2109 aa23.47■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 CCL21O00585 134 aa23.47■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 PDE9AO76083 593 aa23.47■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 FGF4P08620 206 aa23.47■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 GPX3P22352 226 aa23.47■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 PRPH2P23942 346 aa23.47■■□□□ 1.35
CTXN1-201ENST00000318978 PIGAP37287 484 aa23.47■■□□□ 1.35
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