RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317868.8

ATG4C-201, Transcript of autophagy related 4C cysteine peptidase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ATG4C, Length 2,938 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4C-201ENST00000317868 OR10H3O60404 316 aa13□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 CSO75390 466 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 CA3P07451 260 aa13□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 DBTP11182 482 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP13□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 CDK5Q00535 292 aa13□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 COX10Q12887 443 aa13□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 SLC9A5Q14940 896 aa13□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 ENTPD8Q5MY95 495 aa13□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 PODNL1Q6PEZ8 512 aa13□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa13□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 FBXL6Q8N531 539 aa13□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 FAM26EQ8N5C1 309 aa13□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 OR2L5Q8NG80 312 aa13□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 PRRC1Q96M27 445 aa13□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 QPCTLQ9NXS2 382 aa13□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 KCNK6Q9Y257 313 aa13□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 ATG4BQ9Y4P1 393 aa13□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa13□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 ATG2BQ96BY7 2078 aa13□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 LATO43561 262 aa12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 GPX5O75715 221 aa12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 UGT2B17O75795 530 aa12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 SOX14O95416 240 aa12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 MMP11P24347 488 aa12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 FEN1P39748 380 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 GAS1P54826 345 aa12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 RPS21P63220 83 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 TSTQ16762 297 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 NDUFA9Q16795 377 aa12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 UAP1L1Q3KQV9 507 aa12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 TPRG1LQ5T0D9 272 aa12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 ZER1Q7Z7L7 766 aa12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 PGRMC2O15173 223 aa12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 AIFM1O95831 613 aa12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 F3P13726 295 aa12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 NTSP30990 170 aa12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF91Q05481 1191 aa12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 SLAMF1Q13291 335 aa12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 SLC48A1Q6P1K1 146 aa12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 CACUL1Q86Y37 369 aa12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 KRT73Q86Y46 540 aa12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 NANOGP1Q8N7R0 232 aa12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 ACOT4Q8N9L9 421 aa12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 MFSD9Q8NBP5 474 aa12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 OR6T1Q8NGN1 323 aa12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 KLHL6Q8WZ60 621 aa12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 TMEM80Q96HE8 168 aa12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF681Q96N22 645 aa12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 GPA33Q99795 319 aa12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 PINK1Q9BXM7 581 aa12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 CPNE5Q9HCH3 593 aa12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 A0A075B6Q4 140 aa12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 A0A0G2JPF8 293 aa12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 ASNA1O43681 348 aa12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 KIAA0513O60268 411 aa12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 APODP05090 189 aa12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 PPP2R1BP30154 601 aa12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 DGKEP52429 567 aa12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 DNASE1L3Q13609 305 aa12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 MED22Q15528 200 aa12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 CCDC190Q86UF4 302 aa12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 SLC22A16Q86VW1 577 aa12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 PARP16Q8N5Y8 322 aa12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 OR8K5Q8NH50 307 aa12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 IL4I1Q96RQ9 567 aa12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 ARHGDIGQ99819 225 aa12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 KCNK12Q9HB15 430 aa12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 KLF15Q9UIH9 416 aa12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa12.98□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa12.98□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 OR52A4PA6NMU1 304 aa12.98□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 SYT5O00445 386 aa12.98□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 NR2F1P10589 423 aa12.98□□□□□ -0.33
ATG4C-201ENST00000317868 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms