RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300057.4

MESP1-201, Transcript of mesoderm posterior bHLH transcription factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MESP1, Length 2,369 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1-201ENST00000300057 GLOD5A6NK44 160 aa20.3■□□□□ 0.84
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MESP1-201ENST00000300057 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
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MESP1-201ENST00000300057 AMER2Q8N7J2 671 aa20.28■□□□□ 0.84
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