RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 CSHL1Q14406 222 aa14.85□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP14.85□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 RPS6KA2Q15349 733 aa14.85□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 TOMM20Q15388 145 aa14.85□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 DUPD1Q68J44 220 aa14.85□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 SCIMPQ6UWF3 145 aa14.85□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 GALNT7Q86SF2 657 aa14.85□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa14.85□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 MYO1HQ8N1T3 1032 aa14.85□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP14.85□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 PGM2Q96G03 612 aa14.85□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 TSNARE1Q96NA8 513 aa14.85□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 SLC39A3Q9BRY0 314 aa14.85□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa14.84□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 EFCAB8A8MWE9 144 aa14.84□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 HRKO00198 91 aa14.84□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 HCRTR2O43614 444 aa14.84□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 NDUFS7O75251 213 aa14.84□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 TTC4O95801 387 aa14.84□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 TCP1P17987 556 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 IVDP26440 423 aa14.84□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 CERS1P27544 350 aa14.84□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 MSH2P43246 934 aa14.84□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 ID2Q02363 134 aa14.84□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 SPANXN3Q5MJ09 141 aa14.84□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 ANKRD34AQ69YU3 496 aa14.84□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 PACS2Q86VP3 889 aa14.84□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa14.84□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 GPATCH11Q8N954 259 aa14.84□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa14.84□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 SPPL2AQ8TCT8 520 aa14.84□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 CERS2Q96G23 380 aa14.84□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 PLPPR2Q96GM1 343 aa14.84□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM41AQ96HV5 264 aa14.84□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa14.84□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 AIF1LQ9BQI0 150 aa14.84□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 PELI2Q9HAT8 420 aa14.84□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 IKZF3Q9UKT9 509 aa14.84□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa14.83□□□□□ -0.04
SPCS1-201ENST00000233025 PLOD2O00469 737 aa14.83□□□□□ -0.04
SPCS1-201ENST00000233025 CGAP01215 116 aa14.83□□□□□ -0.04
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
SPCS1-201ENST00000233025 IGFBP5P24593 272 aa14.83□□□□□ -0.04
SPCS1-201ENST00000233025 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
SPCS1-201ENST00000233025 FBXW4P57775 412 aa14.83□□□□□ -0.04
SPCS1-201ENST00000233025 FUT7Q11130 342 aa14.83□□□□□ -0.04
SPCS1-201ENST00000233025 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
SPCS1-201ENST00000233025 PPP1R7Q15435 360 aa14.83□□□□□ -0.04
SPCS1-201ENST00000233025 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa14.83□□□□□ -0.04
SPCS1-201ENST00000233025 LIPNQ5VXI9 398 aa14.83□□□□□ -0.04
SPCS1-201ENST00000233025 ADAM5Q6NVV9 412 aa14.83□□□□□ -0.04
SPCS1-201ENST00000233025 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
SPCS1-201ENST00000233025 C12orf54Q6X4T0 127 aa14.83□□□□□ -0.04
SPCS1-201ENST00000233025 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
SPCS1-201ENST00000233025 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
SPCS1-201ENST00000233025 GAL3ST4Q96RP7 486 aa14.83□□□□□ -0.04
SPCS1-201ENST00000233025 WWTR1Q9GZV5 400 aa14.83□□□□□ -0.04
SPCS1-201ENST00000233025 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
SPCS1-201ENST00000233025 ASIC3Q9UHC3 531 aa14.83□□□□□ -0.04
SPCS1-201ENST00000233025 SNX12Q9UMY4 172 aa14.83□□□□□ -0.04
SPCS1-201ENST00000233025 LIPT1Q9Y234 373 aa14.83□□□□□ -0.04
SPCS1-201ENST00000233025 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
SPCS1-201ENST00000233025 LRIT2A6NDA9 550 aa14.82□□□□□ -0.04
SPCS1-201ENST00000233025 TP53I11O14683 189 aa14.82□□□□□ -0.04
SPCS1-201ENST00000233025 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
SPCS1-201ENST00000233025 CTAGE8P0CG41 777 aa14.82□□□□□ -0.04
SPCS1-201ENST00000233025 LHX2P50458 406 aa14.82□□□□□ -0.04
SPCS1-201ENST00000233025 AP1S2P56377 157 aa14.82□□□□□ -0.04
SPCS1-201ENST00000233025 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
SPCS1-201ENST00000233025 EBPQ15125 230 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
SPCS1-201ENST00000233025 TIGD3Q6B0B8 471 aa14.82□□□□□ -0.04
SPCS1-201ENST00000233025 SBSNQ6UWP8 590 aa14.82□□□□□ -0.04
SPCS1-201ENST00000233025 ENPP6Q6UWR7 440 aa14.82□□□□□ -0.04
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM64Q6YI46 380 aa14.82□□□□□ -0.04
SPCS1-201ENST00000233025 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa14.82□□□□□ -0.04
SPCS1-201ENST00000233025 IL17RELQ6ZVW7 336 aa14.82□□□□□ -0.04
SPCS1-201ENST00000233025 TMPRSS11BQ86T26 416 aa14.82□□□□□ -0.04
SPCS1-201ENST00000233025 CTAGE4Q8IX94 777 aa14.82□□□□□ -0.04
SPCS1-201ENST00000233025 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
SPCS1-201ENST00000233025 FBXL8Q96CD0 374 aa14.82□□□□□ -0.04
SPCS1-201ENST00000233025 FBXL20Q96IG2 436 aa14.82□□□□□ -0.04
SPCS1-201ENST00000233025 SERINC2Q96SA4 455 aa14.82□□□□□ -0.04
SPCS1-201ENST00000233025 NAT9Q9BTE0 207 aa14.82□□□□□ -0.04
SPCS1-201ENST00000233025 HEY2Q9UBP5 337 aa14.82□□□□□ -0.04
SPCS1-201ENST00000233025 A0A088AWK7 358 aa14.81□□□□□ -0.04
SPCS1-201ENST00000233025 A0A0G2JK05 382 aa14.81□□□□□ -0.04
SPCS1-201ENST00000233025 GNB5O14775 395 aa14.81□□□□□ -0.04
SPCS1-201ENST00000233025 OR10H2O60403 315 aa14.81□□□□□ -0.04
SPCS1-201ENST00000233025 COX7A2P14406 83 aa14.81□□□□□ -0.04
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
SPCS1-201ENST00000233025 GCKP35557 465 aa14.81□□□□□ -0.04
SPCS1-201ENST00000233025 GMPRP36959 345 aa14.81□□□□□ -0.04
SPCS1-201ENST00000233025 CASP3P42574 277 aa14.81□□□□□ -0.04
SPCS1-201ENST00000233025 PAFAH1B1P43034 410 aa14.81□□□□□ -0.04
SPCS1-201ENST00000233025 STT3AP46977 705 aa14.81□□□□□ -0.04
SPCS1-201ENST00000233025 KCNJ5P48544 419 aa14.81□□□□□ -0.04
SPCS1-201ENST00000233025 PLA2G16P53816 162 aa14.81□□□□□ -0.04
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