RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637548.1

ARID1B-226, Transcript of AT-rich interaction domain 1B, human

Gene ARID1B, Length 2,255 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARID1B-226	ENST00000637548	TRABD	Q9H4I3	376 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	HAO2	Q9NYQ3	351 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	HACD3	Q9P035	362 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	ZNF292	O60281	2723 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	CXorf51A	A0A1B0GTR3	108 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	C2orf92	A0A1B0GVN3	265 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	FAM159B	A6NKW6	160 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	TRIM49D1	C9J1S8	452 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	ACOT7	O00154	380 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	DLL1	O00548	723 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	EIF3H	O15372	352 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	ZNF217	O75362	1048 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	CDK14	O94921	469 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	IGHE	P01854	428 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	SP9	P0CG40	484 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	C8orf89	P0DMQ9	161 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	TDGF1	P13385	188 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	ZNF30	P17039	623 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	ITGAL	P20701	1170 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	ACP1	P24666	158 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	ACRV1	P26436	265 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	AK4	P27144	223 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	STX2	P32856	288 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	HTR2B	P41595	481 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	PREP	P48147	710 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	GLRB	P48167	497 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	CACNG1	Q06432	222 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	ZNF124	Q15973	351 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	C6orf136	Q5SQH8	315 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	C6orf163	Q5TEZ5	329 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	KIAA0895L	Q68EN5	471 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	WDR88	Q6ZMY6	472 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	MACC1	Q6ZN28	852 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	USP30	Q70CQ3	517 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	SNX20	Q7Z614	316 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	TRAPPC5	Q8IUR0	188 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	RBFA	Q8N0V3	343 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	RASGEF1A	Q8N9B8	481 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	BBS1	Q8NFJ9	593 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	PTPMT1	Q8WUK0	201 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	DCAKD	Q8WVC6	231 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	PIGK	Q92643	395 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	GLYATL1	Q969I3	302 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	RNF31	Q96EP0	1072 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	MISP3	Q96FF7	219 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	RANBP9	Q96S59	729 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	SMC6	Q96SB8	1091 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	NEU1	Q99519	415 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	EVA1A	Q9H8M9	152 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	BCO1	Q9HAY6	547 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	NTN4	Q9HB63	628 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	SGK2	Q9HBY8	427 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	FGF22	Q9HCT0	170 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	OLAH	Q9NV23	265 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	EMC3	Q9P0I2	261 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	SLC23A2	Q9UGH3	650 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	FZD4	Q9ULV1	537 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	KCNK6	Q9Y257	313 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	AP4B1	Q9Y6B7	739 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	SPAG17	Q6Q759	2223 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548		A0A1B0GVT2	93 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	ST8SIA3	O43173	380 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	HS6ST1	O60243	411 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	MITF	O75030	526 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	RGS9	O75916	674 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	RHOBTB1	O94844	696 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	SPDEF	O95238	335 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	SYP	P08247	313 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	LINGO3	P0C6S8	592 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	FUT1	P19526	365 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	MSH3	P20585	1137 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	CPN2	P22792	545 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	IL32	P24001	234 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	PDHA2	P29803	388 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	GNPDA1	P46926	289 aa		4.91	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.2 ms