RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628545.1

GLIS1-202, Transcript of GLIS family zinc finger 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene GLIS1, Length 2,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS1-202ENST00000628545 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa16.74■□□□□ 0.27
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GLIS1-202ENST00000628545 MANBAO00462 879 aa16.74■□□□□ 0.27
GLIS1-202ENST00000628545 PRRG1O14668 218 aa16.74■□□□□ 0.27
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GLIS1-202ENST00000628545 HIST1H2AJQ99878 128 aa16.73■□□□□ 0.27
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GLIS1-202ENST00000628545 SELENOWP63302 87 aa16.72■□□□□ 0.27
GLIS1-202ENST00000628545 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP16.72■□□□□ 0.27
GLIS1-202ENST00000628545 CHRNA6Q15825 494 aa16.72■□□□□ 0.27
GLIS1-202ENST00000628545 CTSL3PQ5NE16 218 aa16.72■□□□□ 0.27
GLIS1-202ENST00000628545 FAM180BQ6P0A1 224 aa16.72■□□□□ 0.27
GLIS1-202ENST00000628545 MZT2AQ6P582 158 aa16.72■□□□□ 0.27
GLIS1-202ENST00000628545 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
GLIS1-202ENST00000628545 ARRDC2Q8TBH0 407 aa16.72■□□□□ 0.27
GLIS1-202ENST00000628545 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
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