RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575783.5

CTDNEP1-211, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 876 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-211ENST00000575783 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 PTPN6P29350 595 aa14.78□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 UGT2B10P36537 528 aa14.78□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 KCNJ5P48544 419 aa14.78□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 STARP49675 285 aa14.78□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 SLC37A1P57057 533 aa14.78□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 PCDH1Q08174 1060 aa14.78□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa14.78□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 ANKRD34AQ69YU3 496 aa14.78□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 ENPP6Q6UWR7 440 aa14.78□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa14.78□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa14.78□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa14.78□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 OR1J4Q8NGS1 313 aa14.78□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 RDH11Q8TC12 318 aa14.78□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 IGFBPL1Q8WX77 278 aa14.78□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 STARD4Q96DR4 205 aa14.78□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 MARK4Q96L34 752 aa14.78□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 KRT12Q99456 494 aa14.78□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 DESI2Q9BSY9 194 aa14.78□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 TBCDQ9BTW9 1192 aa14.78□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 VWA7Q9Y334 891 aa14.78□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 C2orf72A6NCS6 295 aa14.77□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 C16orf97H3BN30 126 aa14.77□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 CLGNO14967 610 aa14.77□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 OR10H2O60403 315 aa14.77□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 POU2F1P14859 743 aa14.77□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 LOXP28300 417 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 HNMTP50135 292 aa14.77□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 RPP38P78345 283 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 SETDB1Q15047 1291 aa14.77□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 AP5B1Q2VPB7 878 aa14.77□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 TRIM42Q8IWZ5 723 aa14.77□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 PRR22Q8IZ63 422 aa14.77□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 BBOF1Q8ND07 529 aa14.77□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 MCUQ8NE86 351 aa14.77□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 OR14L1PQ8NHC6 308 aa14.77□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 RIT1Q92963 219 aa14.77□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 PGM2Q96G03 612 aa14.77□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 TMEM41AQ96HV5 264 aa14.77□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 SIGLEC10Q96LC7 697 aa14.77□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 UCN2Q96RP3 112 aa14.77□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 SLC39A3Q9BRY0 314 aa14.77□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 G6PC3Q9BUM1 346 aa14.77□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 SLC17A6Q9P2U8 582 aa14.77□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 CLCF1Q9UBD9 225 aa14.77□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 FETUBQ9UGM5 382 aa14.77□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 MAPRE3Q9UPY8 281 aa14.77□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 USF3Q68DE3 2245 aa14.77□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 OR6C76A6NM76 312 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 SAP18O00422 153 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 CD5LO43866 347 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 TGM6O95932 706 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 KRT14P02533 472 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 FGGP02679 453 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 FREM3P0C091 2139 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 CHMP24386 653 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 SLAMF1Q13291 335 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 BIKQ13323 160 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 VWA1Q6PCB0 445 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 SCIMPQ6UWF3 145 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 C22orf34Q6ZV56 151 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 P4HA3Q7Z4N8 544 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 BTLAQ7Z6A9 289 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 TXLNBQ8N3L3 684 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 TANKQ92844 425 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 DOCK7Q96N67 2140 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 CAPS2Q9BXY5 557 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 METTL7AQ9H8H3 244 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 SERHLQ9NQF3 203 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 SNX15Q9NRS6 342 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 WWOXQ9NZC7 414 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 DSCAMO60469 2012 aa14.75□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 WASHC1A8K0Z3 465 aa14.75□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 PLOD2O00469 737 aa14.75□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 PRAMEF4O60810 478 aa14.75□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 CCKARP32238 428 aa14.75□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 SSR2P43308 183 aa14.75□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 SLC6A12P48065 614 aa14.75□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 TMED10P49755 219 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 NRG3P56975 720 aa14.75□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 CDKL1Q00532 357 aa14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.6 ms