RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 PTGER1P34995 402 aa27.36■■□□□ 1.97
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CTDNEP1-208ENST00000573600 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
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CTDNEP1-208ENST00000573600 COL26A1Q96A83 441 aa27.36■■□□□ 1.97
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CTDNEP1-208ENST00000573600 MAPK11Q15759 364 aa27.36■■□□□ 1.97
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CTDNEP1-208ENST00000573600 IRAK4Q9NWZ3 460 aa27.36■■□□□ 1.97
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ITGA2P17301 1181 aa27.35■■□□□ 1.97
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CTDNEP1-208ENST00000573600 LTB4RQ15722 352 aa27.35■■□□□ 1.97
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CTDNEP1-208ENST00000573600 NRBF2Q96F24 287 aa27.35■■□□□ 1.97
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF347Q96SE7 839 aa27.35■■□□□ 1.97
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CTDNEP1-208ENST00000573600 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa27.33■■□□□ 1.96
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CTDNEP1-208ENST00000573600 SERPINB7O75635 380 aa27.33■■□□□ 1.96
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