RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559460.5

SMAD3-211, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-211ENST00000559460 SNX8Q9Y5X2 465 aa8.74□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 DYSFO75923 2080 aa8.74□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 A0A096LNT2 108 aa8.73□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 A0A0A6YYJ9 748 aa8.73□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 CTAGE9A4FU28 777 aa8.73□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 SLC35F4A4IF30 521 aa8.73□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 C4orf51C9J302 202 aa8.73□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 GOLGA8KD6RF30 607 aa8.73□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 SLCO1B7G3V0H7 640 aa8.73□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 GOLGA8TH3BQL2 631 aa8.73□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 HCRTR2O43614 444 aa8.73□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 CSF3P09919 207 aa8.73□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 CASP3P42574 277 aa8.73□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 STARP49675 285 aa8.73□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 COMPP49747 757 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 NEK2P51955 445 aa8.73□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 ID2Q02363 134 aa8.73□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 TGM3Q08188 693 aa8.73□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 CTBP1Q13363 440 aa8.73□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 RAB35Q15286 201 aa8.73□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 AGAP6Q5VW22 663 aa8.73□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 DUPD1Q68J44 220 aa8.73□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 SBSNQ6UWP8 590 aa8.73□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa8.73□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 C22orf34Q6ZV56 151 aa8.73□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 GPSM1Q86YR5 675 aa8.73□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 OR8K1Q8NGG5 319 aa8.73□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 PROX1Q92786 737 aa8.73□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 NEIL2Q969S2 332 aa8.73□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 FBXL20Q96IG2 436 aa8.73□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 CCDC42Q96M95 316 aa8.73□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 WWTR1Q9GZV5 400 aa8.73□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 SPNS1Q9H2V7 528 aa8.73□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 GOLPH3Q9H4A6 298 aa8.73□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 PELI2Q9HAT8 420 aa8.73□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 ETNK1Q9HBU6 452 aa8.73□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 TREX1Q9NSU2 369 aa8.73□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 ARL15Q9NXU5 204 aa8.73□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 EMC9Q9Y3B6 208 aa8.73□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 TGP01266 2768 aa8.72□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa8.72□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 OR6C76A6NM76 312 aa8.72□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 AP3B1O00203 1094 aa8.72□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 CYR61O00622 381 aa8.72□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 CBR3O75828 277 aa8.72□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 PLGP00747 810 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 TGFAP01135 160 aa8.72□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 APRTP07741 180 aa8.72□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 CCDC166P0CW27 439 aa8.72□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 APEHP13798 732 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 CERS1P27544 350 aa8.72□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 NMBRP28336 390 aa8.72□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 PTPN7P35236 360 aa8.72□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 DEKP35659 375 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 GRIA1P42261 906 aa8.72□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 STT3AP46977 705 aa8.72□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 GDF10P55107 478 aa8.72□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 RPS13P62277 151 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 HERVK_113P63132 956 aa8.72□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 ERVK-8P63133 956 aa8.72□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 CRADDP78560 199 aa8.72□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 FUT7Q11130 342 aa8.72□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 GGTLC2Q14390 218 aa8.72□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 NR1I3Q14994 352 aa8.72□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 IQCB1Q15051 598 aa8.72□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 CYP1B1Q16678 543 aa8.72□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 CR1LQ2VPA4 569 aa8.72□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 FNDC7Q5VTL7 733 aa8.72□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 UGT3A1Q6NUS8 523 aa8.72□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 STK32CQ86UX6 486 aa8.72□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 UBQLNLQ8IYU4 475 aa8.72□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF525Q8N782 197 aa8.72□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 GIMAP7Q8NHV1 300 aa8.72□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 GPR21Q99679 349 aa8.72□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 G6PC3Q9BUM1 346 aa8.72□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 OSBPL11Q9BXB4 747 aa8.72□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 ERVK-6Q9BXR3 956 aa8.72□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 ROGDIQ9GZN7 287 aa8.72□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 IL22Q9GZX6 179 aa8.72□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF696Q9H7X3 374 aa8.72□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 SERHLQ9NQF3 203 aa8.72□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 TAS2R10Q9NYW0 307 aa8.72□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 KLRF1Q9NZS2 232 aa8.72□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 BFARQ9NZS9 450 aa8.72□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 DKKL1Q9UK85 242 aa8.72□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 ERVK-19Q9WJR5 959 aa8.72□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 DHRS7Q9Y394 339 aa8.72□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 COMMD10Q9Y6G5 202 aa8.72□□□□□ -1.01
SMAD3-211ENST00000559460 ANKDD1BA6NHY2 528 aa8.71□□□□□ -1.02
SMAD3-211ENST00000559460 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
SMAD3-211ENST00000559460 IFNB1P01574 187 aa8.71□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.8 ms