RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550167.5

NTM-222, Transcript of neurotrimin, human

TSL 5

Gene NTM, Length 644 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NTM-222	ENST00000550167	SLC35E2	P0CK97	266 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	CPM	P14384	443 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	STT3A	P46977	705 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	EMP2	P54851	167 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	STX1B	P61266	288 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	BTG2	P78543	158 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	FOLH1	Q04609	750 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	RCAN2	Q14206	197 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	FAM91A1	Q658Y4	838 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	TICAM1	Q8IUC6	712 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	MMP21	Q8N119	569 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	KRTCAP2	Q8N6L1	136 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	OR4K14	Q8NGD5	310 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	CLHC1	Q8NHS4	586 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	PSMA8	Q8TAA3	256 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	UCN3	Q969E3	161 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	CNRIP1	Q96F85	164 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	TEX37	Q96LM6	180 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	PTCHD1	Q96NR3	888 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	CRB3	Q9BUF7	120 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	SAR1A	Q9NR31	198 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	C19orf25	Q9UFG5	118 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	UTS2R	Q9UKP6	389 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	FAM234B	A2RU67	622 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	ENO4	A6NNW6	628 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	SCN2B	O60939	215 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	LDB3	O75112	727 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	PRKRA	O75569	313 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	IL6	P05231	212 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	HEXB	P07686	556 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	C8orf89	P0DMQ9	161 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	CSNK2A2	P19784	350 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	PIK3R1	P27986	724 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	IL12A	P29459	219 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	UFM1	P61960	85 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	LRRC74A	Q0VAA2	488 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	STX4	Q12846	297 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	SLC13A2	Q13183	592 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	RPS6KA2	Q15349	733 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	PRSS53	Q2L4Q9	553 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	MPEG1	Q2M385	716 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	MINDY4	Q4G0A6	757 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	CPTP	Q5TA50	214 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	ZNF787	Q6DD87	383 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	BLOC1S3	Q6QNY0	202 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	FUNDC1	Q8IVP5	155 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	ZNF675	Q8TD23	568 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	PPCDC	Q96CD2	204 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	KLHL29	Q96CT2	875 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	ERP27	Q96DN0	273 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	RBCK1	Q9BYM8	510 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	FAM107B	Q9H098	131 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	ADAP2	Q9NPF8	381 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	FAM120C	Q9NX05	1096 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	PCDHGA9	Q9Y5G4	932 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	TNRC6A	Q8NDV7	1962 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	EML6	Q6ZMW3	1958 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	GLOD5	A6NK44	160 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	WASHC1	A8K0Z3	465 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	RNASET2	O00584	256 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	SOCS6	O14544	535 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	CDC123	O75794	336 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	LRAT	O95237	230 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	COX7A2	P14406	83 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	POR	P16435	677 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	MAOA	P21397	527 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	KIR3DL1	P43629	444 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	ALDH9A1	P49189	494 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	XK	P51811	444 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	PGD	P52209	483 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	WNT3	P56703	355 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	RPS18	P62269	152 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	PLIN5	Q00G26	463 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	CHAF1B	Q13112	559 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	IL10RA	Q13651	578 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	NSDHL	Q15738	373 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	ZNF385B	Q569K4	471 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	ANKRD37	Q7Z713	158 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	RAB43	Q86YS6	212 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	TMEM151B	Q8IW70	566 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NTM-222	ENST00000550167	LRRC25	Q8N386	305 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55

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