RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 IGFL3Q6UXB1 125 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 EXOC3L1Q86VI1 746 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 SCUBE1Q8IWY4 988 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 MMP21Q8N119 569 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 METTL4Q8N3J2 472 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 KIF2BQ8N4N8 673 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 DNAJB14Q8TBM8 379 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 M1APQ8TC57 530 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 DOK4Q8TEW6 326 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 AGAP11Q8TF27 550 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 CNDP1Q96KN2 507 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 LMF1Q96S06 567 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 EPS8L2Q9H6S3 715 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 NPHS2Q9NP85 383 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 AHSPQ9NZD4 102 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 PHF11Q9UIL8 331 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 MID2Q9UJV3 735 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 ASB4Q9Y574 426 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 SPACA6W5XKT8 324 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 WDR91A4D1P6 747 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 SAGE2PA6NJ88 616 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 M0R082 166 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 PGRMC2O15173 223 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 CTIFO43310 598 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 TYROBPO43914 113 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 FGF17O60258 216 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 CRCPO75575 148 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 SEMA3DO95025 777 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 COX6B1P14854 86 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 GSTT1P30711 240 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 ARFIP1P53367 373 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 HMGCS1Q01581 520 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 TNFRSF17Q02223 184 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 ZNF33BQ06732 778 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 MFAP5Q13361 173 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 ABHD17BQ5VST6 288 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 CLEC6AQ6EIG7 209 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 IGFL2Q6UWQ7 119 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 FRMD7Q6ZUT3 714 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 CUZD1Q86UP6 607 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 NUDT13Q86X67 352 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 ZNF417Q8TAU3 575 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 TM9SF4Q92544 642 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 CDCP1Q9H5V8 836 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 BRF2Q9HAW0 419 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 MMP25Q9NPA2 562 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 KCNK9Q9NPC2 374 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 MKS1Q9NXB0 559 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 MS4A12Q9NXJ0 267 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 VPS29Q9UBQ0 182 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 PPT2Q9UMR5 302 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 STK38LQ9Y2H1 464 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 FIS1Q9Y3D6 152 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 DOCK10Q96BY6 2186 aa8.96□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 NUP210LQ5VU65 1888 aa8.96□□□□□ -0.97
CS-217ENST00000550044 DYTNA2CJ06 578 aa8.96□□□□□ -0.98
CS-217ENST00000550044 CCDC151A5D8V7 595 aa8.96□□□□□ -0.98
CS-217ENST00000550044 NADKO95544 446 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
CS-217ENST00000550044 AIFM1O95831 613 aa8.96□□□□□ -0.98
CS-217ENST00000550044 WDPCPO95876 746 aa8.96□□□□□ -0.98
CS-217ENST00000550044 ENO1P06733 434 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
CS-217ENST00000550044 CHRNGP07510 517 aa8.96□□□□□ -0.98
CS-217ENST00000550044 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
CS-217ENST00000550044 MAPK12P53778 367 aa8.96□□□□□ -0.98
CS-217ENST00000550044 NAA20P61599 178 aa8.96□□□□□ -0.98
CS-217ENST00000550044 AP2B1P63010 937 aa8.96□□□□□ -0.98
CS-217ENST00000550044 ARG2P78540 354 aa8.96□□□□□ -0.98
CS-217ENST00000550044 FOLH1Q04609 750 aa8.96□□□□□ -0.98
CS-217ENST00000550044 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
CS-217ENST00000550044 ART3Q13508 389 aa8.96□□□□□ -0.98
CS-217ENST00000550044 SERTAD2Q14140 314 aa8.96□□□□□ -0.98
CS-217ENST00000550044 SPDYAQ5MJ70 313 aa8.96□□□□□ -0.98
CS-217ENST00000550044 ACER2Q5QJU3 275 aa8.96□□□□□ -0.98
CS-217ENST00000550044 H3F3CQ6NXT2 135 aa8.96□□□□□ -0.98
CS-217ENST00000550044 LRIG3Q6UXM1 1119 aa8.96□□□□□ -0.98
CS-217ENST00000550044 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa8.96□□□□□ -0.98
CS-217ENST00000550044 Q6ZS92 163 aa8.96□□□□□ -0.98
CS-217ENST00000550044 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa8.96□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55 ms