RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543658.5

DDB1-223, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, human

TSL 4

Gene DDB1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB1-223	ENST00000543658	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	COQ9	O75208	318 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	ERN1	O75460	977 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	CREG1	O75629	220 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	KLF7	O75840	302 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	BCAS2	O75934	225 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	UBOX5	O94941	541 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	CBX6	O95503	412 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	RECK	O95980	971 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	UMOD	P07911	640 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	LIF	P15018	202 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	UQCRC2	P22695	453 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	CPA2	P48052	419 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	TRPC1	P48995	793 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	WNT3	P56703	355 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	PHC1	P78364	1004 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	TGIF1	Q15583	401 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	LTB4R	Q15722	352 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	PRSS53	Q2L4Q9	553 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	MPEG1	Q2M385	716 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	PAPD4	Q6PIY7	484 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	TMEM205	Q6UW68	189 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	TMEM107	Q6UX40	140 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF621	Q6ZSS3	439 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	VASH2	Q86V25	355 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	ADCY4	Q8NFM4	1077 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF675	Q8TD23	568 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	KAT2A	Q92830	837 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	NACC2	Q96BF6	587 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	PPWD1	Q96BP3	646 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	ROPN1L	Q96C74	230 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	IP6K3	Q96PC2	410 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	IL1RL2	Q9HB29	575 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	ZCCHC3	Q9NUD5	404 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	SDAD1	Q9NVU7	687 aa	Known RBP eCLIP	11.12	□□□□□ -0.63	9e-7	■■■□□ 18.1
DDB1-223	ENST00000543658	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	BCAP29	Q9UHQ4	241 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	MRPS18B	Q9Y676	258 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		11.11	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	C15orf38-AP3S2	A0A0A6YYH1	394 aa		11.11	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	NSG1	A0A0A6YYJ2	146 aa		11.11	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	SAGE2P	A6NJ88	616 aa		11.11	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	RRP8	O43159	456 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	KLK10	O43240	276 aa		11.11	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	EMC8	O43402	210 aa		11.11	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	ATP5H	O75947	161 aa		11.11	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	KRT75	O95678	551 aa		11.11	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	NPPA	P01160	153 aa		11.11	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	KRT16	P08779	473 aa		11.11	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	PPIB	P23284	216 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	MC3R	P41968	323 aa		11.11	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	RASSF2	P50749	326 aa		11.11	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	CDK9	P50750	372 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	PRKAG1	P54619	331 aa		11.11	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	HBA1	P69905	142 aa		11.11	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	DUSP2	Q05923	314 aa		11.11	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	CLN3	Q13286	438 aa		11.11	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	TP53BP2	Q13625	1128 aa		11.11	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	TLR1	Q15399	786 aa		11.11	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		11.11	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	PRICKLE4	Q2TBC4	344 aa		11.11	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	PAGE3	Q5JUK9	113 aa		11.11	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	FAM69B	Q5VUD6	431 aa		11.11	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	C16orf89	Q6UX73	402 aa		11.11	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	LRRC69	Q6ZNQ3	347 aa		11.11	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	ARPIN	Q7Z6K5	226 aa		11.11	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	DPP10	Q8N608	796 aa		11.11	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	ZSCAN1	Q8NBB4	408 aa		11.11	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	NUP43	Q8NFH3	380 aa		11.11	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	OR56A1	Q8NGH5	318 aa		11.11	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	OR5AK3P	Q8NH89	298 aa		11.11	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	SNIP1	Q8TAD8	396 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	SFXN5	Q8TD22	340 aa		11.11	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	GTF2H4	Q92759	462 aa		11.11	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	C8orf44	Q96CB5	159 aa		11.11	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	SLC35G5	Q96KT7	338 aa		11.11	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	SLC35A5	Q9BS91	424 aa		11.11	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	INPP5K	Q9BT40	448 aa		11.11	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	DPH1	Q9BZG8	443 aa		11.11	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	OR8D2	Q9GZM6	311 aa		11.11	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	RAD21L1	Q9H4I0	556 aa		11.11	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	CXorf21	Q9HAI6	301 aa		11.11	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	MAT2B	Q9NZL9	334 aa		11.11	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		11.11	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	ERVK-19	Q9WJR5	959 aa		11.11	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		11.11	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		11.11	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	LOC102723996	A0A087X1L8	192 aa		11.1	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	IGHV3-20	A0A0C4DH32	117 aa		11.1	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	CDC14C	A4D256	554 aa		11.1	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	ASPDH	A6ND91	283 aa		11.1	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	EVPLL	A8MZ36	301 aa		11.1	□□□□□ -0.63
DDB1-223	ENST00000543658	FBP2	O00757	339 aa		11.1	□□□□□ -0.63

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