RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543002.5

RABGGTA-203, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTA, Length 1,329 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-203ENST00000543002 DOK4Q8TEW6 326 aa15.93■□□□□ 0.14
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RABGGTA-203ENST00000543002 LMF1Q96S06 567 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-203ENST00000543002 CNPPD1Q9BV87 410 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-203ENST00000543002 DEFB126Q9BYW3 111 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-203ENST00000543002 AIG1Q9NVV5 245 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-203ENST00000543002 SH3BP4Q9P0V3 963 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-203ENST00000543002 TEKT2Q9UIF3 430 aa15.93■□□□□ 0.14
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RABGGTA-203ENST00000543002 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa15.93■□□□□ 0.14
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RABGGTA-203ENST00000543002 PDGFAP04085 211 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGGTA-203ENST00000543002 CT62P0C5K7 136 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGGTA-203ENST00000543002 NTSP30990 170 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGGTA-203ENST00000543002 AQP5P55064 265 aa15.92■□□□□ 0.14
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RABGGTA-203ENST00000543002 ARMC10Q8N2F6 343 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGGTA-203ENST00000543002 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGGTA-203ENST00000543002 OR8K3Q8NH51 312 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGGTA-203ENST00000543002 ZNF675Q8TD23 568 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGGTA-203ENST00000543002 STON2Q8WXE9 905 aa15.92■□□□□ 0.14
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RABGGTA-203ENST00000543002 SLC25A18Q9H1K4 315 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGGTA-203ENST00000543002 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP15.92■□□□□ 0.14
RABGGTA-203ENST00000543002 MAT2BQ9NZL9 334 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGGTA-203ENST00000543002 ZNF639Q9UID6 485 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGGTA-203ENST00000543002 IGSF10Q6WRI0 2623 aa15.91■□□□□ 0.14
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RABGGTA-203ENST00000543002 PDPK1O15530 556 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGGTA-203ENST00000543002 VIMP08670 466 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
RABGGTA-203ENST00000543002 S1PR1P21453 382 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGGTA-203ENST00000543002 SOX18P35713 384 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGGTA-203ENST00000543002 FRKP42685 505 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
RABGGTA-203ENST00000543002 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP15.91■□□□□ 0.14
RABGGTA-203ENST00000543002 SLC37A1P57057 533 aa15.91■□□□□ 0.14
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RABGGTA-203ENST00000543002 ZNF628Q5EBL2 1059 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGGTA-203ENST00000543002 ACER2Q5QJU3 275 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGGTA-203ENST00000543002 ABHD17BQ5VST6 288 aa15.91■□□□□ 0.14
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RABGGTA-203ENST00000543002 OR7A2PQ8NGA2 310 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGGTA-203ENST00000543002 OR9A2Q8NGT5 310 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGGTA-203ENST00000543002 COQ8BQ96D53 544 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGGTA-203ENST00000543002 AMDHD1Q96NU7 426 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGGTA-203ENST00000543002 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
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RABGGTA-203ENST00000543002 SIKE1Q9BRV8 207 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGGTA-203ENST00000543002 CCDC28BQ9BUN5 200 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGGTA-203ENST00000543002 DPY30Q9C005 99 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGGTA-203ENST00000543002 BRINP2Q9C0B6 783 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGGTA-203ENST00000543002 GLIPR2Q9H4G4 154 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGGTA-203ENST00000543002 EPS8L2Q9H6S3 715 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGGTA-203ENST00000543002 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
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RABGGTA-203ENST00000543002 TCF7L2Q9NQB0 619 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGGTA-203ENST00000543002 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
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RABGGTA-203ENST00000543002 OR6C76A6NM76 312 aa15.9■□□□□ 0.14
RABGGTA-203ENST00000543002 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
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RABGGTA-203ENST00000543002 IDO1P14902 403 aa15.9■□□□□ 0.14
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RABGGTA-203ENST00000543002 RNF4P78317 190 aa15.9■□□□□ 0.14
RABGGTA-203ENST00000543002 GSTA3Q16772 222 aa15.9■□□□□ 0.14
RABGGTA-203ENST00000543002 CPTPQ5TA50 214 aa15.9■□□□□ 0.14
RABGGTA-203ENST00000543002 TMEM198Q66K66 360 aa15.9■□□□□ 0.14
RABGGTA-203ENST00000543002 RNF111Q6ZNA4 994 aa15.9■□□□□ 0.14
RABGGTA-203ENST00000543002 LINC00696Q6ZRV3 163 aa15.9■□□□□ 0.14
RABGGTA-203ENST00000543002 CAMKMTQ7Z624 323 aa15.9■□□□□ 0.14
RABGGTA-203ENST00000543002 NATD1Q8N6N6 113 aa15.9■□□□□ 0.14
RABGGTA-203ENST00000543002 NUDT8Q8WV74 236 aa15.9■□□□□ 0.14
RABGGTA-203ENST00000543002 TM9SF4Q92544 642 aa15.9■□□□□ 0.14
RABGGTA-203ENST00000543002 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
RABGGTA-203ENST00000543002 ERP27Q96DN0 273 aa15.9■□□□□ 0.14
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