RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525997.1

PUM1-216, Transcript of pumilio RNA binding family member 1, human

TSL 3

Gene PUM1, Length 650 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUM1-216	ENST00000525997		A0A1W2PNU3	283 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997		A0A1W2PQ72	361 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	SAGE2P	A6NJ88	616 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	GLOD5	A6NK44	160 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	DUXA	A6NLW8	204 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	EVPLL	A8MZ36	301 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	FAM227A	F5H4B4	570 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	PLOD2	O00469	737 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	MRAS	O14807	208 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	PGRMC2	O15173	223 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	KLK10	O43240	276 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	EMC8	O43402	210 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	PLOD3	O60568	738 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	DNAJA2	O60884	412 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	LDB3	O75112	727 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	CREG1	O75629	220 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	MED26	O95402	600 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	STAMBP	O95630	424 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	C6orf47	O95873	294 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	B3GALT4	O96024	378 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	AK1	P00568	194 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	HP	P00738	406 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	ZCCHC18	P0CG32	403 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	LAMP1	P11279	417 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	COX4I1	P13073	169 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	MAOA	P21397	527 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	OTX2	P32243	289 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	SOAT1	P35610	550 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	CHI3L1	P36222	383 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	FEN1	P39748	380 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	CLCN2	P51788	898 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	DCAF7	P61962	342 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	LSM11	P83369	360 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	MXRA7	P84157	204 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	VAC14	Q08AM6	782 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	MAP4K2	Q12851	820 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	HSPB3	Q12988	150 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	NFYC	Q13952	458 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	GNA13	Q14344	377 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	SPATS1	Q496A3	300 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	SFT2D3	Q587I9	215 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	ATAD3B	Q5T9A4	648 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	HLA-DQA1	Q5Y7H0	255 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	CPZ	Q66K79	652 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	OR4F3	Q6IEY1	312 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	FAM199X	Q6PEV8	388 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	PAPD4	Q6PIY7	484 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	TMEM205	Q6UW68	189 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	RNF111	Q6ZNA4	994 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	NDUFAF7	Q7L592	441 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	TIPARP	Q7Z3E1	657 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	SZRD1	Q7Z422	152 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	CPEB2	Q7Z5Q1	589 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	ANKRD37	Q7Z713	158 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	TMEM151B	Q8IW70	566 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	CCDC116	Q8IYX3	515 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	DPP10	Q8N608	796 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	TMEM102	Q8N9M5	508 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	CLEC1A	Q8NC01	280 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	OR7A2P	Q8NGA2	310 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	OR8K3	Q8NH51	312 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	GOT1L1	Q8NHS2	421 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	PSMA8	Q8TAA3	256 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	M1AP	Q8TC57	530 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	PMEPA1	Q969W9	287 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	ANKRD9	Q96BM1	317 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	CNRIP1	Q96F85	164 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	VMP1	Q96GC9	406 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	FBXL20	Q96IG2	436 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	NSL1	Q96IY1	281 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	EGLN2	Q96KS0	407 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	ZNF681	Q96N22	645 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	AMDHD1	Q96NU7	426 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	MS4A4E	Q96PG1	132 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	UCN2	Q96RP3	112 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	CCNL2	Q96S94	520 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	HOPX	Q9BPY8	73 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	CNPPD1	Q9BV87	410 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	CACYBP	Q9HB71	228 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	SLC22A11	Q9NSA0	550 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	ZCCHC3	Q9NUD5	404 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	ARMCX1	Q9P291	453 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	TEKT2	Q9UIF3	430 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	CES1P1	Q9UKY3	287 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	POLH	Q9Y253	713 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-216	ENST00000525997	SNX8	Q9Y5X2	465 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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