RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525861.5

ACER3-204, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 2

Gene ACER3, Length 2,058 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-204ENST00000525861 NUP43Q8NFH3 380 aa21.84■■□□□ 1.09
ACER3-204ENST00000525861 KAT2AQ92830 837 aa21.84■■□□□ 1.09
ACER3-204ENST00000525861 TANKQ92844 425 aa21.84■■□□□ 1.09
ACER3-204ENST00000525861 COL26A1Q96A83 441 aa21.84■■□□□ 1.09
ACER3-204ENST00000525861 ANKRD60Q9BZ19 345 aa21.84■■□□□ 1.09
ACER3-204ENST00000525861 NCOR1O75376 2440 aa21.84■■□□□ 1.09
ACER3-204ENST00000525861 ASXL3Q9C0F0 2248 aa21.83■■□□□ 1.09
ACER3-204ENST00000525861 DPM1O60762 260 aa21.83■■□□□ 1.09
ACER3-204ENST00000525861 PDE9AO76083 593 aa21.83■■□□□ 1.09
ACER3-204ENST00000525861 PORP16435 677 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
ACER3-204ENST00000525861 CHN2P52757 468 aa21.83■■□□□ 1.09
ACER3-204ENST00000525861 FAM53BQ14153 422 aa21.83■■□□□ 1.09
ACER3-204ENST00000525861 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
ACER3-204ENST00000525861 TCTE1Q5JU00 501 aa21.83■■□□□ 1.09
ACER3-204ENST00000525861 GARNL3Q5VVW2 1013 aa21.83■■□□□ 1.09
ACER3-204ENST00000525861 HIPK1Q86Z02 1210 aa21.83■■□□□ 1.09
ACER3-204ENST00000525861 ARMC8Q8IUR7 673 aa21.83■■□□□ 1.09
ACER3-204ENST00000525861 SHISA5Q8N114 240 aa21.83■■□□□ 1.09
ACER3-204ENST00000525861 SPPL2AQ8TCT8 520 aa21.83■■□□□ 1.09
ACER3-204ENST00000525861 XAGE5Q8WWM1 108 aa21.83■■□□□ 1.09
ACER3-204ENST00000525861 DUSP23Q9BVJ7 150 aa21.83■■□□□ 1.09
ACER3-204ENST00000525861 BATF3Q9NR55 127 aa21.83■■□□□ 1.09
ACER3-204ENST00000525861 VNN3Q9NY84 501 aa21.83■■□□□ 1.09
ACER3-204ENST00000525861 NTMQ9P121 344 aa21.83■■□□□ 1.09
ACER3-204ENST00000525861 CLCA2Q9UQC9 943 aa21.83■■□□□ 1.09
ACER3-204ENST00000525861 U3KQV3 271 aa21.83■■□□□ 1.09
ACER3-204ENST00000525861 SPTBP11277 2137 aa21.83■■□□□ 1.09
ACER3-204ENST00000525861 B4GAT1O43505 415 aa21.83■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 DIRAS1O95057 198 aa21.83■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 HS3ST5Q8IZT8 346 aa21.83■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 OSBPL10Q9BXB5 764 aa21.83■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 USE1Q9NZ43 259 aa21.83■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 SCN2AQ99250 2005 aa21.82■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa21.82■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 I3L1I5 382 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 PLOD2O00469 737 aa21.82■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 FOXS1O43638 330 aa21.82■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 SLC28A2O43868 658 aa21.82■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 FGF17O60258 216 aa21.82■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 LDB3O75112 727 aa21.82■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 MED26O95402 600 aa21.82■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 GPR75O95800 540 aa21.82■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 PPP2R1BP30154 601 aa21.82■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 PPP2R2BQ00005 443 aa21.82■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 CFHR1Q03591 330 aa21.82■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 GK3PQ14409 553 aa21.82■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 AMZ1Q400G9 498 aa21.82■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 OR7G2Q8NG99 324 aa21.82■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 SCOCQ9UIL1 159 aa21.82■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa21.81■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 FAM227AF5H4B4 570 aa21.81■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 CHST10O43529 356 aa21.81■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 MYF5P13349 255 aa21.81■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 SYPL1Q16563 259 aa21.81■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 SLC36A3Q495N2 470 aa21.81■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 TMEM154Q6P9G4 183 aa21.81■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 GATAD2AQ86YP4 633 aa21.81■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 LGI4Q8N135 537 aa21.81■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 SMYD1Q8NB12 490 aa21.81■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 GIMAP5Q96F15 307 aa21.81■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 YIPF4Q9BSR8 244 aa21.81■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 ANKRA2Q9H9E1 313 aa21.81■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 IRAK4Q9NWZ3 460 aa21.81■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa21.81■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 MUC3AQ02505 3323 aa21.81■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 HYKKA2RU49 373 aa21.81■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 NSA2O95478 260 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 SNAP29O95721 258 aa21.81■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 ATP1B1P05026 303 aa21.81■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 NR2F1P10589 423 aa21.81■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 ID2Q02363 134 aa21.81■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 HLA-BQ31612 363 aa21.81■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 INAVAQ3KP66 663 aa21.81■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 DHRSXQ8N5I4 330 aa21.81■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 TMEM105Q8N8V8 129 aa21.81■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 SAP25Q8TEE9 199 aa21.81■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 C16orf58Q96GQ5 468 aa21.81■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 RDH12Q96NR8 316 aa21.81■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 ZNF607Q96SK3 696 aa21.81■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 NDUFAF4Q9P032 175 aa21.81■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 PTGFRNQ9P2B2 879 aa21.81■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 FITM1A5D6W6 292 aa21.8■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 TMEM221A6NGB7 291 aa21.8■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 M0R296 226 aa21.8■■□□□ 1.08
ACER3-204ENST00000525861 ASNA1O43681 348 aa21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.3 ms