RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521404.5

MEG3-217, Transcript of maternally expressed 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene MEG3, Length 1,426 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEG3-217ENST00000521404 DDCP20711 480 aa14.83□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 FEN1P39748 380 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 NME5P56597 212 aa14.83□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 C6orf163Q5TEZ5 329 aa14.83□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 FAM71E1Q6IPT2 247 aa14.83□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 LINC00696Q6ZRV3 163 aa14.83□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 IKBIPQ70UQ0 350 aa14.83□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 SPATA19Q7Z5L4 167 aa14.83□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 TICAM1Q8IUC6 712 aa14.83□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 FCRL1Q96LA6 429 aa14.83□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 BBS4Q96RK4 519 aa14.83□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 RNF32Q9H0A6 362 aa14.83□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 ENTPD4Q9Y227 616 aa14.83□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa14.83□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 NBASA2RRP1 2371 aa14.82□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa14.82□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 A0A0G2JND7 137 aa14.82□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa14.82□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 ZNF195O14628 629 aa14.82□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 UBDO15205 165 aa14.82□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 PORP16435 677 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 NT5EP21589 574 aa14.82□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 HPCAL1P37235 193 aa14.82□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 IDH3AP50213 366 aa14.82□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 DIO3P55073 304 aa14.82□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 GNGT1P63211 74 aa14.82□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 PLIN5Q00G26 463 aa14.82□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 PTGR1Q14914 329 aa14.82□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 BTBD16Q32M84 506 aa14.82□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 ZNF750Q32MQ0 723 aa14.82□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 PLAG1Q6DJT9 500 aa14.82□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa14.82□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 RFWD2Q8NHY2 731 aa14.82□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 ACTRT2Q8TDY3 377 aa14.82□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 DOK4Q8TEW6 326 aa14.82□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 PPCDCQ96CD2 204 aa14.82□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 MARK4Q96L34 752 aa14.82□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa14.82□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 OR52B2Q96RD2 323 aa14.82□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 EBF4Q9BQW3 602 aa14.82□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 CCDC134Q9H6E4 229 aa14.82□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 REEP4Q9H6H4 257 aa14.82□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 ADAP2Q9NPF8 381 aa14.82□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 TCF7L2Q9NQB0 619 aa14.82□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 PTGFRNQ9P2B2 879 aa14.82□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 TRAV17A0A0B4J275 112 aa14.81□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 C17orf105B2RV13 164 aa14.81□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 AGFG2O95081 481 aa14.81□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 DDX5P17844 614 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 STT3AP46977 705 aa14.81□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 ARG2P78540 354 aa14.81□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 INAQ16352 499 aa14.81□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 EXT1Q16394 746 aa14.81□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 CCDC116Q8IYX3 515 aa14.81□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 FAM9CQ8IZT9 166 aa14.81□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 CHMP6Q96FZ7 201 aa14.81□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 DPY30Q9C005 99 aa14.81□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 FAM107BQ9H098 131 aa14.81□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 CES1P1Q9UKY3 287 aa14.81□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 CSAG2Q9Y5P2 127 aa14.81□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 A0A1W2PS29 197 aa14.8□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 E9PBE3 544 aa14.8□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 CDK2AP1O14519 115 aa14.8□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 DDAH2O95865 285 aa14.8□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 SLC35E2P0CK97 266 aa14.8□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 GP1BBP13224 206 aa14.8□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 CPMP14384 443 aa14.8□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 NTSP30990 170 aa14.8□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 RPL3P39023 403 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 TNFSF10P50591 281 aa14.8□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 PGS1Q32NB8 556 aa14.8□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 ABHD17BQ5VST6 288 aa14.8□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 TMEM198Q66K66 360 aa14.8□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa14.8□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa14.8□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP14.8□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 M1APQ8TC57 530 aa14.8□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 SSC4DQ8WTU2 575 aa14.8□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 RIT1Q92963 219 aa14.8□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 SIKE1Q9BRV8 207 aa14.8□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 CCDC28BQ9BUN5 200 aa14.8□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 BRINP2Q9C0B6 783 aa14.8□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa14.8□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 EHD3Q9NZN3 535 aa14.8□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 SHANK1Q9Y566 2161 aa14.79□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 ANKUB1A6NFN9 424 aa14.79□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 SAGE2PA6NJ88 616 aa14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms