RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502571.1

FBXO38-204, Transcript of F-box protein 38, human

TSL 2

Gene FBXO38, Length 605 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO38-204	ENST00000502571	PTPRU	Q92729	1446 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FBXO38-204	ENST00000502571	FER1L5	A0AVI2	2057 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FBXO38-204	ENST00000502571		A0A1B0GU03	582 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FBXO38-204	ENST00000502571		A0A1W2PPR1	153 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FBXO38-204	ENST00000502571	PI15	O43692	258 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FBXO38-204	ENST00000502571	MT-ATP6	P00846	226 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FBXO38-204	ENST00000502571	PROS1	P07225	676 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FBXO38-204	ENST00000502571	CCDC159	P0C7I6	412 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FBXO38-204	ENST00000502571	FOSL2	P15408	326 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FBXO38-204	ENST00000502571	SLC1A4	P43007	532 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FBXO38-204	ENST00000502571	PRELP	P51888	382 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FBXO38-204	ENST00000502571	MS4A2	Q01362	244 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FBXO38-204	ENST00000502571	RAPSN	Q13702	412 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FBXO38-204	ENST00000502571	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FBXO38-204	ENST00000502571	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
FBXO38-204	ENST00000502571	UNC50	Q53HI1	259 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FBXO38-204	ENST00000502571	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FBXO38-204	ENST00000502571	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
FBXO38-204	ENST00000502571	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FBXO38-204	ENST00000502571	KDM8	Q8N371	416 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FBXO38-204	ENST00000502571	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FBXO38-204	ENST00000502571	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FBXO38-204	ENST00000502571	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FBXO38-204	ENST00000502571	TMEM45B	Q96B21	275 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FBXO38-204	ENST00000502571	DEFB118	Q96PH6	123 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FBXO38-204	ENST00000502571	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FBXO38-204	ENST00000502571	C1orf21	Q9H246	121 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FBXO38-204	ENST00000502571	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FBXO38-204	ENST00000502571	JPT2	Q9H910	190 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FBXO38-204	ENST00000502571	PAK5	Q9P286	719 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FBXO38-204	ENST00000502571	EIF3K	Q9UBQ5	218 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
FBXO38-204	ENST00000502571	LHX3	Q9UBR4	397 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FBXO38-204	ENST00000502571	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FBXO38-204	ENST00000502571	KLK13	Q9UKR3	277 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FBXO38-204	ENST00000502571	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FBXO38-204	ENST00000502571	SPATA2	Q9UM82	520 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FBXO38-204	ENST00000502571	KLHDC2	Q9Y2U9	406 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FBXO38-204	ENST00000502571	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FBXO38-204	ENST00000502571	ATG4B	Q9Y4P1	393 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FBXO38-204	ENST00000502571	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FBXO38-204	ENST00000502571	TXNL1	O43396	289 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FBXO38-204	ENST00000502571	PRPSAP2	O60256	369 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FBXO38-204	ENST00000502571	HPR	P00739	348 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FBXO38-204	ENST00000502571	TGFA	P01135	160 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FBXO38-204	ENST00000502571	LMO2	P25791	158 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FBXO38-204	ENST00000502571	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
FBXO38-204	ENST00000502571	MAT2A	P31153	395 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
FBXO38-204	ENST00000502571	TRIM23	P36406	574 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FBXO38-204	ENST00000502571	NPY2R	P49146	381 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FBXO38-204	ENST00000502571	GSK3B	P49841	420 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FBXO38-204	ENST00000502571	BPIFB3	P59826	476 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FBXO38-204	ENST00000502571	ACY1	Q03154	408 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FBXO38-204	ENST00000502571	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FBXO38-204	ENST00000502571	EMC2	Q15006	297 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FBXO38-204	ENST00000502571	CCL14	Q16627	93 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FBXO38-204	ENST00000502571	HAGH	Q16775	308 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FBXO38-204	ENST00000502571	HKDC1	Q2TB90	917 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FBXO38-204	ENST00000502571	TOR1AIP1	Q5JTV8	583 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FBXO38-204	ENST00000502571	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FBXO38-204	ENST00000502571	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FBXO38-204	ENST00000502571	SAMD8	Q96LT4	415 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FBXO38-204	ENST00000502571	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FBXO38-204	ENST00000502571	ACCS	Q96QU6	501 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FBXO38-204	ENST00000502571		Q9HAA7	133 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FBXO38-204	ENST00000502571	PLEKHA6	Q9Y2H5	1048 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FBXO38-204	ENST00000502571	ZNF175	Q9Y473	711 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FBXO38-204	ENST00000502571	ZMYM6	O95789	1325 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FBXO38-204	ENST00000502571	PCNX3	Q9H6A9	2034 aa		4.09	□□□□□ -1.76
FBXO38-204	ENST00000502571	RNF212B	A8MTL3	300 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FBXO38-204	ENST00000502571	ADAM12	O43184	909 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FBXO38-204	ENST00000502571	SSX5	O60225	188 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FBXO38-204	ENST00000502571	UBE4B	O95155	1302 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FBXO38-204	ENST00000502571	HCK	P08631	526 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FBXO38-204	ENST00000502571	ZCCHC18	P0CG32	403 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FBXO38-204	ENST00000502571	PRDX6	P30041	224 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FBXO38-204	ENST00000502571	HSPA1L	P34931	641 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FBXO38-204	ENST00000502571	SLC6A8	P48029	635 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FBXO38-204	ENST00000502571	AFF2	P51816	1311 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FBXO38-204	ENST00000502571	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
FBXO38-204	ENST00000502571	AGK	Q53H12	422 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FBXO38-204	ENST00000502571	AGAP7P	Q5VUJ5	663 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FBXO38-204	ENST00000502571	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FBXO38-204	ENST00000502571	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FBXO38-204	ENST00000502571	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
FBXO38-204	ENST00000502571	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FBXO38-204	ENST00000502571	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FBXO38-204	ENST00000502571	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FBXO38-204	ENST00000502571	CNNM3	Q8NE01	707 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FBXO38-204	ENST00000502571	C17orf47	Q8NEP4	570 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FBXO38-204	ENST00000502571	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
FBXO38-204	ENST00000502571	PHYHIP	Q92561	330 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FBXO38-204	ENST00000502571	NLN	Q9BYT8	704 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FBXO38-204	ENST00000502571	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FBXO38-204	ENST00000502571	ATG10	Q9H0Y0	220 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FBXO38-204	ENST00000502571	GNB4	Q9HAV0	340 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FBXO38-204	ENST00000502571	CNOT2	Q9NZN8	540 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
FBXO38-204	ENST00000502571	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FBXO38-204	ENST00000502571	MIOX	Q9UGB7	285 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FBXO38-204	ENST00000502571	IL20RA	Q9UHF4	553 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FBXO38-204	ENST00000502571	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76

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