RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	9.95	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		9.95	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	EPB41L4B	Q9H329	900 aa		9.95	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF703	Q9H7S9	590 aa	Predicted RBP	9.95	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	9.95	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	PCDHGB3	Q9Y5G1	929 aa		9.95	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNE2	Q9Y6J6	123 aa		9.95	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	CTAGE15	A4D2H0	777 aa		9.94	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	GOLGA8M	H3BSY2	632 aa		9.94	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAPPC6A	O75865	159 aa		9.94	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	EPPIN	O95925	133 aa		9.94	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		9.94	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	SMIM10L1	P0DMW3	83 aa		9.94	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	COX7A2	P14406	83 aa		9.94	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	9.94	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	TIMP3	P35625	211 aa		9.94	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNJ1	P48048	391 aa		9.94	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	9.94	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	IL2	P60568	153 aa		9.94	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	TBL3	Q12788	808 aa	Known RBP	9.94	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	GPS1	Q13098	491 aa		9.94	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	9.94	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	TOMM20	Q15388	145 aa		9.94	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	HSP90AA5P	Q58FG0	334 aa		9.94	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIM40	Q6P9F5	258 aa		9.94	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	CTAGE6	Q86UF2	777 aa		9.94	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	THOC6	Q86W42	341 aa	Known RBP	9.94	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		9.94	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	SUPV3L1	Q8IYB8	786 aa	Known RBP eCLIP	9.94	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	KLHDC8A	Q8IYD2	350 aa		9.94	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	PM20D2	Q8IYS1	436 aa		9.94	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	9.94	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF321P	Q8N8H1	164 aa		9.94	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM52	Q8NDY8	209 aa		9.94	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	TTL	Q8NG68	377 aa		9.94	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	OR8K3	Q8NH51	312 aa		9.94	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC2A12	Q8TD20	617 aa		9.94	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	MAIP1	Q8WWC4	291 aa		9.94	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	FBXL8	Q96CD0	374 aa		9.94	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	SMIM10	Q96HG1	83 aa		9.94	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIB1	Q96RU8	372 aa		9.94	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	EGFL8	Q99944	293 aa		9.94	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	DOHH	Q9BU89	302 aa		9.94	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		9.94	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	CAMK2A	Q9UQM7	478 aa		9.94	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	9.94	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	HIVEP2	P31629	2446 aa		9.94	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	ZCWPW2	A0A1B0GU75	182 aa		9.93	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	CTNS	O60931	367 aa		9.93	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	ERN1	O75460	977 aa	Known RBP	9.93	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	HPX	P02790	462 aa		9.93	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	HRG	P04196	525 aa		9.93	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	ENO2	P09104	434 aa	Predicted RBP	9.93	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	BMP7	P18075	431 aa		9.93	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	CEACAM8	P31997	349 aa	Predicted RBP	9.93	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	OPRM1	P35372	400 aa		9.93	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	MSH2	P43246	934 aa		9.93	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	RPL21	P46778	160 aa	Known RBP	9.93	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF136	P52737	540 aa		9.93	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	DUSP8	Q13202	625 aa		9.93	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	SERTAD2	Q14140	314 aa		9.93	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	9.93	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	9.93	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		9.93	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	PTPMT1	Q8WUK0	201 aa	Predicted RBP	9.93	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	PIGT	Q969N2	578 aa		9.93	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	DACH2	Q96NX9	599 aa		9.93	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	SERINC2	Q96SA4	455 aa		9.93	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	CSF3R	Q99062	836 aa		9.93	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	DESI2	Q9BSY9	194 aa		9.93	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	RBM24	Q9BX46	236 aa	Known RBP	9.93	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	XAB2	Q9HCS7	855 aa	Known RBP	9.93	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	ACKR4	Q9NPB9	350 aa		9.93	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	QPCTL	Q9NXS2	382 aa		9.93	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC22A14	Q9Y267	594 aa		9.93	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	SPACA6	W5XKT8	324 aa		9.93	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	SH3D21	A4FU49	640 aa		9.92	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKDD1B	A6NHY2	528 aa		9.92	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	KDM4E	B2RXH2	506 aa	Predicted RBP	9.92	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF354A	O60765	605 aa	Predicted RBP	9.92	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	LDB3	O75112	727 aa		9.92	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	LRAT	O95237	230 aa		9.92	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	CTSS	P25774	331 aa		9.92	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	CERS1	P27544	350 aa		9.92	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	SERPINB3	P29508	390 aa		9.92	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	9.92	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	MTTP	P55157	894 aa		9.92	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	CDKN2D	P55273	166 aa		9.92	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	LIM2	P55344	173 aa		9.92	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	ID2	Q02363	134 aa		9.92	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	TEK	Q02763	1124 aa		9.92	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	CHRNE	Q04844	493 aa		9.92	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	TGM3	Q08188	693 aa		9.92	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	RCAN2	Q14206	197 aa		9.92	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	MPEG1	Q2M385	716 aa		9.92	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	PIGG	Q5H8A4	983 aa		9.92	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	9.92	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		9.92	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	NSUN5P2	Q63ZY6	315 aa		9.92	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	OGFOD2	Q6N063	350 aa		9.92	□□□□□ -0.82

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