RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 FBXL6Q8N531 539 aa12.17□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 POC5Q8NA72 575 aa12.17□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 OR8K5Q8NH50 307 aa12.17□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 COL21A1Q96P44 957 aa12.17□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 BTBD1Q9H0C5 482 aa12.17□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 PCBD2Q9H0N5 130 aa12.17□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 GLIPR2Q9H4G4 154 aa12.17□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 RNF167Q9H6Y7 350 aa12.17□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 ZNF556Q9HAH1 456 aa12.17□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 A4GALTQ9NPC4 353 aa12.17□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 OBP2AQ9NY56 170 aa12.17□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 DUSP12Q9UNI6 340 aa12.17□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 SLC28A2O43868 658 aa12.17□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 C8orf89P0DMQ9 161 aa12.17□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 C5AR1P21730 350 aa12.17□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 SERPINB1P30740 379 aa12.17□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 CTSKP43235 329 aa12.17□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 RAB28P51157 221 aa12.17□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 DUSP2Q05923 314 aa12.17□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa12.17□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 TCTN3Q6NUS6 607 aa12.17□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 DEF8Q6ZN54 512 aa12.17□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa12.17□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 GATAD2AQ86YP4 633 aa12.17□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 TAGAPQ8N103 731 aa12.17□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 OR52E1Q8NGJ3 308 aa12.17□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 MCFD2Q8NI22 146 aa12.17□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 DHRS1Q96LJ7 313 aa12.17□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 DACH2Q96NX9 599 aa12.17□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 CTRCQ99895 268 aa12.17□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 BCL7BQ9BQE9 202 aa12.17□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP12.17□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 SLC6A20Q9NP91 592 aa12.17□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 FBXO8Q9NRD0 319 aa12.17□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 IMPAD1Q9NX62 359 aa12.17□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 MS4A12Q9NXJ0 267 aa12.17□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 ANKMY1Q9P2S6 941 aa12.17□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 TRPC4Q9UBN4 977 aa12.17□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 KLHL3Q9UH77 587 aa12.17□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 CA5BQ9Y2D0 317 aa12.17□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 A0A0A6YYD5 115 aa12.16□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 ANKRD34BA5PLL1 514 aa12.16□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 CLCA1A8K7I4 914 aa12.16□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 K7EQS6 105 aa12.16□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 HAT1O14929 419 aa12.16□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 SOX14O95416 240 aa12.16□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 CHMP24386 653 aa12.16□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 GRK5P34947 590 aa12.16□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 IGFALSP35858 605 aa12.16□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 FEN1P39748 380 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 GPR19Q15760 415 aa12.16□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 LRIT3Q3SXY7 679 aa12.16□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP12.16□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP12.16□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa12.16□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 TMEM145Q8NBT3 493 aa12.16□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 QRFPRQ96P65 431 aa12.16□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 BTBD2Q9BX70 525 aa12.16□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP12.16□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 DCSTAMPQ9H295 470 aa12.16□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 OR51I1Q9H343 314 aa12.16□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 ANKRA2Q9H9E1 313 aa12.16□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa12.16□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 NARSO43776 548 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 CDK1P06493 297 aa12.16□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 CD40LGP29965 261 aa12.16□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 CNR2P34972 360 aa12.16□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 GPC1P35052 558 aa12.16□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 FRKP42685 505 aaPredicted RBP12.16□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 PXNP49023 591 aaPredicted RBP12.16□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 ST3GAL4Q11206 333 aa12.16□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 HYAL2Q12891 473 aa12.16□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 SHHQ15465 462 aa12.16□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 AKAP14Q86UN6 197 aa12.16□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa12.16□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP12.16□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 DMRTB1Q96MA1 342 aa12.16□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 AMDHD1Q96NU7 426 aa12.16□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa12.16□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 SLC17A9Q9BYT1 436 aa12.16□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 DSN1Q9H410 356 aa12.16□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 NT5DC2Q9H857 520 aa12.16□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 ATG4BQ9Y4P1 393 aa12.16□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP12.16□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 SNPHO15079 494 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 ERI3O43414 337 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 TPST2O60704 377 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 TBX19O60806 448 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 EML2O95834 649 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 PTHP01270 115 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 DNTTP04053 509 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 GADD45AP24522 165 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 PKLRP30613 574 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 RAB8AP61006 207 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-213ENST00000492657 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms