RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	UQCRHL	A0A096LP55	91 aa		16.02	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A0A6YYD5	115 aa		16.02	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A1B0GTL3	188 aa		16.02	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	SERTM1	A2A2V5	107 aa		16.02	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	OR6C76	A6NM76	312 aa		16.02	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	16.02	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM114	B3SHH9	223 aa		16.02	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	NPIPA5	E9PKD4	350 aa		16.02	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	UBFD1	O14562	309 aa	Known RBP	16.02	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	LDB3	O75112	727 aa		16.02	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	OR2J2	O76002	312 aa		16.02	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	HSPA4L	O95757	839 aa		16.02	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	SERPINE1	P05121	402 aa		16.02	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	ALOX15	P16050	662 aa	Predicted RBP	16.02	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	DCT	P40126	519 aa		16.02	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	HK2	P52789	917 aa		16.02	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	SPIN4	Q56A73	249 aa		16.02	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	PIGG	Q5H8A4	983 aa		16.02	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	16.02	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		16.02	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	CCNYL2	Q5T2Q4	361 aa		16.02	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	PAOX	Q6QHF9	649 aa		16.02	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	CLYBL	Q8N0X4	340 aa		16.02	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	PSD4	Q8NDX1	1056 aa		16.02	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF721	Q8TF20	911 aa		16.02	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	ASB15	Q8WXK1	588 aa		16.02	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC120	Q96HB5	630 aa		16.02	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	SENP5	Q96HI0	755 aa	Predicted RBP	16.02	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	DGAT2	Q96PD7	388 aa		16.02	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	RASL10B	Q96S79	203 aa		16.02	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		16.02	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	NPIPA1	Q9UND3	350 aa		16.02	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	ERVK-11	Q9UQG0	969 aa		16.02	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	ATG4B	Q9Y4P1	393 aa		16.02	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424		E9PLN8	166 aa		16.01	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC28A1	O00337	649 aa		16.01	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	16.01	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	RGS14	O43566	566 aa		16.01	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	FGF17	O60258	216 aa		16.01	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM58BP	P0C7Q3	252 aa		16.01	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC35E2	P0CK97	266 aa		16.01	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	MEOX1	P50221	254 aa		16.01	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	ACSM2A	Q08AH3	577 aa		16.01	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	CHI3L2	Q15782	390 aa		16.01	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	HYAL4	Q2M3T9	481 aa		16.01	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	NDUFAF5	Q5TEU4	345 aa		16.01	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	ACSM2B	Q68CK6	577 aa		16.01	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	RTL4	Q6ZR62	310 aa		16.01	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	METTL4	Q8N3J2	472 aa		16.01	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	CPSF7	Q8N684	471 aa	Known RBP	16.01	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	16.01	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	CCT7	Q99832	543 aa		16.01	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		16.01	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	OR8D2	Q9GZM6	311 aa		16.01	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		16.01	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	TEX15	Q9BXT5	2789 aa		16	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	PRRG2	O14669	202 aa		16	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	PRKN	O60260	465 aa	Predicted RBP	16	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	ETHE1	O95571	254 aa		16	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	KLK1	P06870	262 aa		16	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	FGF4	P08620	206 aa		16	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	16	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	CNR1	P21554	472 aa		16	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	MAPK12	P53778	367 aa		16	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	FOLH1	Q04609	750 aa		16	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	STX3	Q13277	289 aa		16	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		16	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		16	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	ATG16L1	Q676U5	607 aa		16	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF787	Q6DD87	383 aa		16	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		16	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	TICAM1	Q8IUC6	712 aa		16	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	16	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	MGARP	Q8TDB4	240 aa		16	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	KCNA7	Q96RP8	456 aa		16	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	MRPL1	Q9BYD6	325 aa	Known RBP	16	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	16	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	MEMO1	Q9Y316	297 aa		16	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		16	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	CENPE	Q02224	2701 aa		16	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		15.99	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	TFEC	O14948	347 aa	Predicted RBP	15.99	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		15.99	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	NR2F6	P10588	404 aa		15.99	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	ABO	P16442	354 aa		15.99	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	GSTM5	P46439	218 aa		15.99	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	15.99	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	ABCE1	P61221	599 aa	Known RBP	15.99	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	TRA2B	P62995	288 aa	Known RBP	15.99	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	C3AR1	Q16581	482 aa		15.99	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	15.99	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	15.99	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	OR52E8	Q6IFG1	317 aa		15.99	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	ARHGAP11A	Q6P4F7	1023 aa		15.99	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	GK5	Q6ZS86	529 aa		15.99	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	COMMD6	Q7Z4G1	85 aa		15.99	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	TRIM46	Q7Z4K8	759 aa		15.99	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	MDGA2	Q7Z553	956 aa		15.99	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		15.99	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		15.99	■□□□□ 0.15

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