RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488426.5

NELFE-209, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 5

Gene NELFE, Length 1,855 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-209ENST00000488426 LRRC36Q1X8D7 754 aa11.97□□□□□ -0.49
NELFE-209ENST00000488426 SPDYE7PQ495Y7 208 aa11.97□□□□□ -0.49
NELFE-209ENST00000488426 TCTE1Q5JU00 501 aa11.97□□□□□ -0.49
NELFE-209ENST00000488426 COX20Q5RI15 118 aa11.97□□□□□ -0.49
NELFE-209ENST00000488426 GARNL3Q5VVW2 1013 aa11.97□□□□□ -0.49
NELFE-209ENST00000488426 HMBOX1Q6NT76 420 aa11.97□□□□□ -0.49
NELFE-209ENST00000488426 C19orf48Q6RUI8 117 aa11.97□□□□□ -0.49
NELFE-209ENST00000488426 RNF130Q86XS8 419 aa11.97□□□□□ -0.49
NELFE-209ENST00000488426 FBXO30Q8TB52 745 aa11.97□□□□□ -0.49
NELFE-209ENST00000488426 MOAP1Q96BY2 351 aa11.97□□□□□ -0.49
NELFE-209ENST00000488426 C10orf90Q96M02 699 aa11.97□□□□□ -0.49
NELFE-209ENST00000488426 RNF145Q96MT1 663 aa11.97□□□□□ -0.49
NELFE-209ENST00000488426 SEPHS2Q99611 448 aa11.97□□□□□ -0.49
NELFE-209ENST00000488426 CHID1Q9BWS9 393 aa11.97□□□□□ -0.49
NELFE-209ENST00000488426 VCXQ9H320 206 aa11.97□□□□□ -0.49
NELFE-209ENST00000488426 ANKHQ9HCJ1 492 aa11.97□□□□□ -0.49
NELFE-209ENST00000488426 SOHLH2Q9NX45 425 aa11.97□□□□□ -0.49
NELFE-209ENST00000488426 SEMA5BQ9P283 1151 aa11.97□□□□□ -0.49
NELFE-209ENST00000488426 RPS6KA6Q9UK32 745 aa11.97□□□□□ -0.49
NELFE-209ENST00000488426 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
NELFE-209ENST00000488426 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa11.97□□□□□ -0.49
NELFE-209ENST00000488426 MGAQ8IWI9 3026 aa11.97□□□□□ -0.49
NELFE-209ENST00000488426 FAM208BQ5VWN6 2430 aa11.96□□□□□ -0.49
NELFE-209ENST00000488426 PRKD3O94806 890 aa11.96□□□□□ -0.49
NELFE-209ENST00000488426 ATP6V1C1P21283 382 aa11.96□□□□□ -0.49
NELFE-209ENST00000488426 CCT3P49368 545 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
NELFE-209ENST00000488426 NR0B2Q15466 257 aa11.96□□□□□ -0.49
NELFE-209ENST00000488426 ATP6AP1Q15904 470 aa11.96□□□□□ -0.49
NELFE-209ENST00000488426 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
NELFE-209ENST00000488426 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
NELFE-209ENST00000488426 NKAIN2Q5VXU1 208 aa11.96□□□□□ -0.49
NELFE-209ENST00000488426 BHLHB9Q6PI77 547 aa11.96□□□□□ -0.49
NELFE-209ENST00000488426 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
NELFE-209ENST00000488426 PDSS2Q86YH6 399 aa11.96□□□□□ -0.49
NELFE-209ENST00000488426 SUN3Q8TAQ9 357 aa11.96□□□□□ -0.49
NELFE-209ENST00000488426 FAM110BQ8TC76 370 aa11.96□□□□□ -0.49
NELFE-209ENST00000488426 IFI44Q8TCB0 444 aa11.96□□□□□ -0.49
NELFE-209ENST00000488426 SLC47A1Q96FL8 570 aa11.96□□□□□ -0.49
NELFE-209ENST00000488426 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
NELFE-209ENST00000488426 ZNF681Q96N22 645 aa11.96□□□□□ -0.49
NELFE-209ENST00000488426 ENAMQ9NRM1 1142 aa11.96□□□□□ -0.49
NELFE-209ENST00000488426 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
NELFE-209ENST00000488426 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa11.96□□□□□ -0.49
NELFE-209ENST00000488426 V9GYQ6 96 aa11.96□□□□□ -0.49
NELFE-209ENST00000488426 UNC13CQ8NB66 2214 aa11.96□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 WASHC1A8K0Z3 465 aa11.95□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 B4GAT1O43505 415 aa11.95□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 TPST1O60507 370 aa11.95□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 MT-CO3P00414 261 aa11.95□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 LDLRP01130 860 aa11.95□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 NUDT7P0C024 238 aa11.95□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 ARAFP10398 606 aa11.95□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 PRIM2P49643 509 aa11.95□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 EMP3P54852 163 aa11.95□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 DSTNP60981 165 aa11.95□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 ILKQ13418 452 aa11.95□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 FAM53BQ14153 422 aa11.95□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 C16orf72Q14CZ0 275 aa11.95□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 CDCP2Q5VXM1 449 aa11.95□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 ENPP6Q6UWR7 440 aa11.95□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 FKBP9P1Q75LS8 142 aa11.95□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 PRSS41Q7RTY9 318 aa11.95□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 C6orf120Q7Z4R8 191 aa11.95□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 SPRED1Q7Z699 444 aa11.95□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 AMIGO2Q86SJ2 522 aa11.95□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 KMT5CQ86Y97 462 aa11.95□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 FAM86B1Q8N7N1 296 aa11.95□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 OR4K14Q8NGD5 310 aa11.95□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 EME1Q96AY2 570 aa11.95□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 CRELD1Q96HD1 420 aa11.95□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 PYURFQ96I23 114 aa11.95□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa11.95□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 STARD5Q9NSY2 213 aa11.95□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 CLCA2Q9UQC9 943 aa11.95□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 PMS2P1A4D2B8 440 aa11.95□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 FITM1A5D6W6 292 aa11.95□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 ZNF860A6NHJ4 632 aa11.95□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 H0YJX3 145 aa11.95□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 CD1CP29017 333 aa11.95□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 RAB38P57729 211 aa11.95□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 HSD11B2P80365 405 aa11.95□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 SQSTM1Q13501 440 aa11.95□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 SCARB2Q14108 478 aa11.95□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 SFT2D3Q587I9 215 aa11.95□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 CBLL1Q75N03 491 aa11.95□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 CCDC80Q76M96 950 aa11.95□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 PRSS42Q7Z5A4 293 aa11.95□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 CCDC116Q8IYX3 515 aa11.95□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 CA13Q8N1Q1 262 aa11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms