RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486268.5

ERGIC3-215, Transcript of ERGIC and golgi 3, human

TSL 2

Gene ERGIC3, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERGIC3-215	ENST00000486268	RUNX2	Q13950	521 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	PDK3	Q15120	406 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	NRF1	Q16656	503 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	RFX4	Q33E94	735 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	INAVA	Q3KP66	663 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	IFI44L	Q53G44	452 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	NHSL2	Q5HYW2	709 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	OR2T5	Q6IEZ7	315 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	KMT5C	Q86Y97	462 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	ARMC8	Q8IUR7	673 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	CCDC116	Q8IYX3	515 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	SLC25A45	Q8N413	288 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	ARHGEF39	Q8N4T4	335 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	OR2T29	Q8NH02	315 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	NFKBID	Q8NI38	313 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	SAP25	Q8TEE9	199 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	MAL2	Q969L2	176 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	TMBIM1	Q969X1	311 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	ZNF607	Q96SK3	696 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	MAP3K3	Q99759	626 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	RBM4B	Q9BQ04	359 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	RBM4	Q9BWF3	364 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	KLHL25	Q9H0H3	589 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	PDE7B	Q9NP56	450 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	THSD1	Q9NS62	852 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	ZCCHC3	Q9NUD5	404 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	UCKL1	Q9NWZ5	548 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	LRIT1	Q9P2V4	623 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	P2RX2	Q9UBL9	471 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	SCOC	Q9UIL1	159 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	RNF215	Q9Y6U7	377 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	CEP250	Q9BV73	2442 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	C7orf72	A4D263	438 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	FITM1	A5D6W6	292 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	GLOD5	A6NK44	160 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	DUXA	A6NLW8	204 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268		M0QX08	132 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	HMGN4	O00479	90 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	GCM2	O75603	506 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	SERPINB7	O75635	380 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	C1QC	P02747	245 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	C9	P02748	559 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	MSL3P1	P0C860	447 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	ZNF883	P0CG24	379 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	CD59	P13987	128 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	POR	P16435	677 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	MATN1	P21941	496 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	MLLT3	P42568	568 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	XK	P51811	444 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	CHN2	P52757	468 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	ARSF	P54793	590 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	ITGA1	P56199	1179 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	PPP1CA	P62136	330 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	BLMH	Q13867	455 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	DAG1	Q14118	895 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	C16orf72	Q14CZ0	275 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	STPG1	Q5TH74	334 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	SHQ1	Q6PI26	577 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	LGI4	Q8N135	537 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	CA13	Q8N1Q1	262 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	HORMAD2	Q8N7B1	307 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	BBS10	Q8TAM1	723 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	SLC38A5	Q8WUX1	472 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	GEMIN6	Q8WXD5	167 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	TFAP2C	Q92754	450 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	ELP4	Q96EB1	424 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	BTBD2	Q9BX70	525 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	GABARAPL1	Q9H0R8	117 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	BCL2L10	Q9HD36	194 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	FAM60A	Q9NP50	221 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	CALML5	Q9NZT1	146 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	LIPT1	Q9Y234	373 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	MRPS33	Q9Y291	106 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	NAALAD2	Q9Y3Q0	740 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	PCNX2	A6NKB5	2137 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	SPEG	Q15772	3267 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268		A0A087WV62	115 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	CYR61	O00622	381 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	EI24	O14681	340 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	ADAMDEC1	O15204	470 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ERGIC3-215	ENST00000486268	PCDHGA12	O60330	932 aa		11.09	□□□□□ -0.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.3 ms