RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 MPEG1Q2M385 716 aa19.41■□□□□ 0.7
ACTB-211ENST00000480301 PIGGQ5H8A4 983 aa19.41■□□□□ 0.7
ACTB-211ENST00000480301 SH2D4BQ5SQS7 431 aa19.41■□□□□ 0.7
ACTB-211ENST00000480301 FAM180BQ6P0A1 224 aa19.41■□□□□ 0.7
ACTB-211ENST00000480301 RNF111Q6ZNA4 994 aa19.41■□□□□ 0.7
ACTB-211ENST00000480301 HOMEZQ8IX15 550 aa19.41■□□□□ 0.7
ACTB-211ENST00000480301 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa19.41■□□□□ 0.7
ACTB-211ENST00000480301 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa19.41■□□□□ 0.7
ACTB-211ENST00000480301 DNAJB8Q8NHS0 232 aa19.41■□□□□ 0.7
ACTB-211ENST00000480301 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP19.41■□□□□ 0.72e-13■□□□□ 11
ACTB-211ENST00000480301 ESPL1Q14674 2120 aa19.4■□□□□ 0.7
ACTB-211ENST00000480301 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP19.4■□□□□ 0.7
ACTB-211ENST00000480301 ASPDHA6ND91 283 aa19.4■□□□□ 0.7
ACTB-211ENST00000480301 OR6C76A6NM76 312 aa19.4■□□□□ 0.7
ACTB-211ENST00000480301 SEC22BO75396 215 aa19.4■□□□□ 0.7
ACTB-211ENST00000480301 OR6B1O95007 311 aa19.4■□□□□ 0.7
ACTB-211ENST00000480301 ATP1B1P05026 303 aa19.4■□□□□ 0.7
ACTB-211ENST00000480301 SOX3P41225 446 aa19.4■□□□□ 0.7
ACTB-211ENST00000480301 TDGF1P3P51864 188 aa19.4■□□□□ 0.7
ACTB-211ENST00000480301 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP19.4■□□□□ 0.74e-11■■■□□ 17.2
ACTB-211ENST00000480301 ZNF763Q0D2J5 394 aa19.4■□□□□ 0.7
ACTB-211ENST00000480301 MAP4K2Q12851 820 aa19.4■□□□□ 0.7
ACTB-211ENST00000480301 MAPKAPK3Q16644 382 aa19.4■□□□□ 0.7
ACTB-211ENST00000480301 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa19.4■□□□□ 0.7
ACTB-211ENST00000480301 FAM71E1Q6IPT2 247 aa19.4■□□□□ 0.7
ACTB-211ENST00000480301 NOXRED1Q6NXP6 359 aa19.4■□□□□ 0.7
ACTB-211ENST00000480301 MDGA2Q7Z553 956 aa19.4■□□□□ 0.7
ACTB-211ENST00000480301 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa19.4■□□□□ 0.7
ACTB-211ENST00000480301 ZNF615Q8N8J6 731 aa19.4■□□□□ 0.7
ACTB-211ENST00000480301 TWIST2Q8WVJ9 160 aa19.4■□□□□ 0.7
ACTB-211ENST00000480301 ASB15Q8WXK1 588 aa19.4■□□□□ 0.7
ACTB-211ENST00000480301 NR4A3Q92570 626 aa19.4■□□□□ 0.7
ACTB-211ENST00000480301 LRTM1Q9HBL6 345 aa19.4■□□□□ 0.7
ACTB-211ENST00000480301 TMBIM4Q9HC24 238 aa19.4■□□□□ 0.7
ACTB-211ENST00000480301 C1orf109Q9NX04 203 aa19.4■□□□□ 0.7
ACTB-211ENST00000480301 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa19.4■□□□□ 0.7
ACTB-211ENST00000480301 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa19.4■□□□□ 0.7
ACTB-211ENST00000480301 TENM4Q6N022 2769 aa19.4■□□□□ 0.7
ACTB-211ENST00000480301 CLEC18AA5D8T8 446 aa19.39■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 ANKUB1A6NFN9 424 aa19.39■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 A8MVJ9 347 aa19.39■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 ZWINTO95229 277 aa19.39■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 NADKO95544 446 aaPredicted RBP19.39■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 CRYABP02511 175 aaKnown RBP19.39■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 NEFHP12036 1026 aa19.39■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 EDN3P14138 238 aa19.39■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 DDCP20711 480 aa19.39■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 MST1P26927 711 aa19.39■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 PTGER1P34995 402 aa19.39■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 C2orf80Q0P641 193 aa19.39■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 CASP8Q14790 479 aa19.39■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 EBPQ15125 230 aaKnown RBP19.39■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 CEBPEQ15744 281 aa19.39■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 PRSS53Q2L4Q9 553 aa19.39■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP19.39■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 FAM111BQ6SJ93 734 aa19.39■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 CLEC18BQ6UXF7 455 aa19.39■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 IL20RBQ6UXL0 311 aa19.39■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 SLC29A4Q7RTT9 530 aa19.39■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP19.39■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 CLEC18CQ8NCF0 446 aa19.39■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 AGR3Q8TD06 166 aa19.39■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 TMEM125Q96AQ2 219 aa19.39■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP19.39■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 FCRL1Q96LA6 429 aa19.39■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 WWTR1Q9GZV5 400 aa19.39■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 OR10A5Q9H207 317 aa19.39■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 MYNNQ9NPC7 610 aa19.39■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 HPF1Q9NWY4 346 aa19.39■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 MAT2BQ9NZL9 334 aa19.39■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP19.39■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 ERVK-11Q9UQG0 969 aa19.39■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP19.39■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 PIP5K1BO14986 540 aa19.38■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 ITM2AO43736 263 aa19.38■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 WISP2O76076 250 aa19.38■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 SERPINE1P05121 402 aa19.38■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 TACR1P25103 407 aa19.38■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 POLEQ07864 2286 aa19.38■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 CHI3L2Q15782 390 aa19.38■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 LYPD8Q6UX82 237 aa19.38■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 CCDC116Q8IYX3 515 aa19.38■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 ZNF441Q8N8Z8 693 aa19.38■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 ADCY4Q8NFM4 1077 aa19.38■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 OR7G1Q8NGA0 311 aa19.38■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa19.38■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 CTHRC1Q96CG8 243 aa19.38■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 FRMD6Q96NE9 622 aa19.38■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 BRINP2Q9C0B6 783 aa19.38■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa19.38■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 EHD3Q9NZN3 535 aa19.38■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 ZNF639Q9UID6 485 aa19.38■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP19.38■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 SVILO95425 2214 aa19.37■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 LSM1O15116 133 aaKnown RBP19.37■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 DUSP8Q13202 625 aa19.37■□□□□ 0.69
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