RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477529.1

SRRT-210, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 540 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-210ENST00000477529 TM9SF1O15321 606 aa13.05□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 CTIFO43310 598 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 DYRK3O43781 588 aa13.05□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 NME2P1O60361 137 aa13.05□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 RASAL1O95294 804 aa13.05□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 SP1P08047 785 aa13.05□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 DHRS4L1P0CG22 281 aa13.05□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 NME2P22392 152 aa13.05□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 SSTR4P31391 388 aa13.05□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 PTGER1P34995 402 aa13.05□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 SOX3P41225 446 aa13.05□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 SSR4P51571 173 aa13.05□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 XKP51811 444 aa13.05□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 SLC37A1P57057 533 aa13.05□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 EBPQ15125 230 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 SPDYAQ5MJ70 313 aa13.05□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 FAM180BQ6P0A1 224 aa13.05□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 RNF111Q6ZNA4 994 aa13.05□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa13.05□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 GALNT12Q8IXK2 581 aa13.05□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 HORMAD2Q8N7B1 307 aa13.05□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 TMEM178AQ8NBL3 297 aa13.05□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa13.05□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 AGR3Q8TD06 166 aa13.05□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 C16orf78Q8WTQ4 265 aa13.05□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 NR4A3Q92570 626 aa13.05□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 FRMD6Q96NE9 622 aa13.05□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa13.05□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 ACTL7BQ9Y614 415 aa13.05□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 ASPDHA6ND91 283 aa13.04□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 OR6B1O95007 311 aa13.04□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 ZWINTO95229 277 aa13.04□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 ATP1B1P05026 303 aa13.04□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 FGF4P08620 206 aa13.04□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 EDN3P14138 238 aa13.04□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 PORP16435 677 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 MST1P26927 711 aa13.04□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 SOX18P35713 384 aa13.04□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 SERPINB5P36952 375 aa13.04□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 FEN1P39748 380 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 GSTM5P46439 218 aa13.04□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 FUT7Q11130 342 aa13.04□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 MPP2Q14168 576 aa13.04□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 KIAA0040Q15053 153 aa13.04□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa13.04□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 UGT3A2Q3SY77 523 aa13.04□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 SH2D4BQ5SQS7 431 aa13.04□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 Q6ZSR9 355 aa13.04□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP13.04□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 TWIST2Q8WVJ9 160 aa13.04□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 ASB15Q8WXK1 588 aa13.04□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 ZNF681Q96N22 645 aa13.04□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 WWTR1Q9GZV5 400 aa13.04□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 MYNNQ9NPC7 610 aa13.04□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 MAT2BQ9NZL9 334 aa13.04□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 UTS2RQ9UKP6 389 aa13.04□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 ANKUB1A6NFN9 424 aa13.03□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 A8MVJ9 347 aa13.03□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 SLC28A1O00337 649 aa13.03□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 NADKO95544 446 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 CHEK2O96017 543 aa13.03□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 MYZAPP0CAP1 466 aa13.03□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 NEFHP12036 1026 aa13.03□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 DRD2P14416 443 aa13.03□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 NT5EP21589 574 aa13.03□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 MGAT2Q10469 447 aa13.03□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 CEBPEQ15744 281 aa13.03□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 MAPKAPK3Q16644 382 aa13.03□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 MPEG1Q2M385 716 aa13.03□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 SLC25A25Q6KCM7 469 aa13.03□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 NOXRED1Q6NXP6 359 aa13.03□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 MDGA2Q7Z553 956 aa13.03□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 NUDCD3Q8IVD9 361 aa13.03□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 VWA5B2Q8N398 1253 aa13.03□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 ZNF615Q8N8J6 731 aa13.03□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 OR5L2Q8NGL0 311 aa13.03□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 CDC26Q8NHZ8 85 aa13.03□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 FAM76AQ8TAV0 307 aa13.03□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 TMEM125Q96AQ2 219 aa13.03□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 FCRL1Q96LA6 429 aa13.03□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 GAL3ST4Q96RP7 486 aa13.03□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP13.03□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 HPF1Q9NWY4 346 aa13.03□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 EHD3Q9NZN3 535 aa13.03□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 TRAF6Q9Y4K3 522 aa13.03□□□□□ -0.32
SRRT-210ENST00000477529 WDR91A4D1P6 747 aa13.02□□□□□ -0.33
SRRT-210ENST00000477529 OR6C76A6NM76 312 aa13.02□□□□□ -0.33
SRRT-210ENST00000477529 PIP5K1BO14986 540 aa13.02□□□□□ -0.33
SRRT-210ENST00000477529 LSM1O15116 133 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms