RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 FGD5Q6ZNL6 1462 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 LOC105371242A0A075B767 164 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A1W2PS18 150 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 HELTA6NFD8 242 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 LRRC30A6NM36 301 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 KLF11O14901 512 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 CTAGE5O15320 804 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 CFLARO15519 480 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 LRCH4O75427 683 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 IGHV4-59P01825 116 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 GSTT2P0CG29 244 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 GSTT2BP0CG30 244 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 PRKAR1AP10644 381 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 FEN1P39748 380 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 FHITP49789 147 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 SGSHP51688 502 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 PRRX1P54821 245 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 SRYQ05066 204 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 PLD1Q13393 1074 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 ETFDHQ16134 617 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF699Q32M78 642 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM106AQ4KMX7 169 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 DCAF12Q5T6F0 453 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 TAF3Q5VWG9 929 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 STEAP1BQ6NZ63 245 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 TUBA1AQ71U36 451 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 TTC5Q8N0Z6 440 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 OR5AU1Q8NGC0 362 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 NPAS2Q99743 824 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 TUBA1CQ9BQE3 449 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM43Q9BTV4 400 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 ELOVL3Q9HB03 270 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 C1orf123Q9NWV4 160 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 BARHL2Q9NY43 387 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 FZR1Q9UM11 496 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 AP4B1Q9Y6B7 739 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 MEI4A8MW99 385 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 ANHXE9PGG2 379 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC1A7O00341 560 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 ZSCAN12O43309 604 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 OR1F1O43749 312 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 TSHBP01222 138 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 CRYABP02511 175 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 FCER2P06734 321 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 CAPN1P07384 714 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 CPN1P15169 458 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 GRIA1P42261 906 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 OR3A2P47893 321 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 HTR5AP47898 357 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 NDST1P52848 882 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 RCN1Q15293 331 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 CDKN3Q16667 212 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 HKDC1Q2TB90 917 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 SPANXN4Q5MJ08 99 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF841Q6ZN19 808 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 Q6ZVQ6 151 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 DPY19L4Q7Z388 723 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 LINC00518Q8N0U6 118 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 OR4C3Q8NH37 302 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 SECTM1Q8WVN6 248 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 RASD2Q96D21 266 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 OMA1Q96E52 524 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 GIMAP5Q96F15 307 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 AKR1E2Q96JD6 320 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 ST6GAL2Q96JF0 529 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 MED20Q9H944 212 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC25A19Q9HC21 320 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 CRLF2Q9HC73 371 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 STARD5Q9NSY2 213 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 WIPI2Q9Y4P8 454 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 FKBP7Q9Y680 259 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 SELENOKQ9Y6D0 94 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 WDR19Q8NEZ3 1342 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 TCP10L2B9ZVM9 353 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 H0YL77 283 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 H3BMH7 237 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 ARPC3O15145 178 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 ALOX15BO15296 676 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 IGHEP01854 428 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-209ENST00000473406 GPIP06744 558 aa5.3□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms