RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 SPAG7O75391 227 aa22.17■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 GP1BBP13224 206 aa22.17■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 SERPINB3P29508 390 aa22.17■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 SSTR4P31391 388 aa22.17■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 FEN1P39748 380 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 RAE1P78406 368 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 IMPG1Q17R60 797 aa22.17■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 FJX1Q86VR8 437 aa22.17■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 FAM111AQ96PZ2 611 aa22.17■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 WWTR1Q9GZV5 400 aa22.17■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 DEPPQ9NTK1 212 aa22.17■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa22.17■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 TFECO14948 347 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 CLPSP04118 112 aa22.16■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 IL3P08700 152 aa22.16■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 CT62P0C5K7 136 aa22.16■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 FUT7Q11130 342 aa22.16■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 EBPQ15125 230 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 SLC15A4Q8N697 577 aa22.16■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 GOLM1Q8NBJ4 401 aa22.16■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 MAGED4Q96JG8 741 aa22.16■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 SMC6Q96SB8 1091 aa22.16■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 TMEM109Q9BVC6 243 aa22.16■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 EBPLQ9BY08 206 aa22.16■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa22.16■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 SLC17A7Q9P2U7 560 aa22.16■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 HEY2Q9UBP5 337 aa22.16■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa22.16■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa22.15■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 A1L4Q6 167 aa22.15■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 G3V3Y1 287 aa22.15■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 SLC19A2O60779 497 aa22.15■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 NADKO95544 446 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 UROSP10746 265 aa22.15■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 DRD2P14416 443 aa22.15■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa22.15■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 GALNT18Q6P9A2 607 aa22.15■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 GHDCQ8N2G8 530 aa22.15■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 OR2M7Q8NG81 312 aa22.15■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 C16orf78Q8WTQ4 265 aa22.15■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 RELTQ969Z4 430 aa22.15■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 BRINP2Q9C0B6 783 aa22.15■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 OR10A5Q9H207 317 aa22.15■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa22.15■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 UTS2RQ9UKP6 389 aa22.15■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 RAB21Q9UL25 225 aa22.15■■□□□ 1.14
SMKR1-201ENST00000462322 P04436 131 aa22.14■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 ATP1B1P05026 303 aa22.14■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 ALDH3A1P30838 453 aa22.14■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 CASP6P55212 293 aa22.14■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
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SMKR1-201ENST00000462322 CLEC6AQ6EIG7 209 aa22.14■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 FAM180BQ6P0A1 224 aa22.14■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 MYO7BQ6PIF6 2116 aa22.14■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 TRIM46Q7Z4K8 759 aa22.14■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 VWA5B2Q8N398 1253 aa22.14■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF615Q8N8J6 731 aa22.14■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 OR7G1Q8NGA0 311 aa22.14■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 C16orf52Q8NHV5 167 aa22.14■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 TCP10LQ8TDR4 215 aa22.14■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 TRMOQ9BU70 441 aa22.14■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 PFDN4Q9NQP4 134 aa22.14■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 SACM1LQ9NTJ5 587 aa22.14■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 SIRT5Q9NXA8 310 aa22.14■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 A0A0G2JMM0 328 aa22.13■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 A0A1W2PPB8 328 aa22.13■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 A0A1W2PRS3 328 aa22.13■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 PINLYPA6NC86 204 aa22.13■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 KIR3DP1A8MWS1 328 aa22.13■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 HS6ST1O60243 411 aa22.13■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 CNR1P21554 472 aa22.13■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 PTGER1P34995 402 aa22.13■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 HSF1Q00613 529 aa22.13■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 PLGLB1Q02325 96 aa22.13■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 HEPACAMQ14CZ8 416 aa22.13■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 FAM111BQ6SJ93 734 aa22.13■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 LYPD8Q6UX82 237 aa22.13■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 FAM47EQ6ZV65 393 aa22.13■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 TAGAPQ8N103 731 aa22.13■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 ADCY4Q8NFM4 1077 aa22.13■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 CDC26Q8NHZ8 85 aa22.13■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 FAM173AQ9BQD7 235 aa22.13■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 CROCCQ5TZA2 2017 aa22.13■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 CCL21O00585 134 aa22.12■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 AZIN1O14977 448 aa22.12■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 CCL3P10147 92 aa22.12■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 CREB1P16220 341 aa22.12■■□□□ 1.13
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