RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 ERVK-19Q9WJR5 959 aa15.65■□□□□ 0.1
RABGEF1-204ENST00000442563 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa15.65■□□□□ 0.1
RABGEF1-204ENST00000442563 NEURL1O76050 574 aa15.64■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 S1PR1P21453 382 aa15.64■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 RPL14P50914 215 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 HK2P52789 917 aa15.64■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC37A1P57057 533 aa15.64■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 MGAT2Q10469 447 aa15.64■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 BST1Q10588 318 aa15.64■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa15.64■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 PIGGQ5H8A4 983 aa15.64■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF766Q5HY98 468 aa15.64■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 SPINK14Q6IE38 97 aa15.64■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 RNF111Q6ZNA4 994 aa15.64■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM156Q8N614 296 aa15.64■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF781Q8N8C0 355 aa15.64■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 CTHRC1Q96CG8 243 aa15.64■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 SCMH1Q96GD3 660 aa15.64■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa15.64■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 SORT1Q99523 831 aa15.64■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 GIMAP4Q9NUV9 329 aa15.64■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 THAP1Q9NVV9 213 aa15.64■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 ANKRD10Q9NXR5 420 aa15.64■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF639Q9UID6 485 aa15.64■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 OR2J2O76002 312 aa15.63■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 CLPSP04118 112 aa15.63■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 CT62P0C5K7 136 aa15.63■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 TACR1P25103 407 aa15.63■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 MPIP34949 423 aa15.63■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 SSR4P51571 173 aa15.63■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa15.63■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 C6orf163Q5TEZ5 329 aa15.63■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC25A25Q6KCM7 469 aa15.63■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC29A4Q7RTT9 530 aa15.63■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF227Q86WZ6 799 aa15.63■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 TICAM1Q8IUC6 712 aa15.63■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 C9orf40Q8IXQ3 194 aa15.63■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 CCDC116Q8IYX3 515 aa15.63■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC15A4Q8N697 577 aa15.63■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF615Q8N8J6 731 aa15.63■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF675Q8TD23 568 aa15.63■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 TP53INP1Q96A56 240 aa15.63■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 ERP27Q96DN0 273 aa15.63■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 C3orf30Q96M34 536 aa15.63■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 RASL10BQ96S79 203 aa15.63■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 TRIM4Q9C037 500 aa15.63■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 MIEF1Q9NQG6 463 aa15.63■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa15.63■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 MAT2BQ9NZL9 334 aa15.63■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 ENTPD4Q9Y227 616 aa15.63■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 CFL2Q9Y281 166 aa15.63■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 WWP2O00308 870 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 TBX19O60806 448 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 PEX11AO75192 247 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 WISP1O95388 367 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 SP1P08047 785 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 SDC1P18827 310 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 MAPK1P28482 360 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 ASMTP46597 345 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 RPL38P63173 70 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 DUSP2Q05923 314 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 IGFBP7Q16270 282 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 SMU1Q2TAY7 513 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 GALNTL6Q49A17 601 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 C6orf136Q5SQH8 315 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 ATG16L1Q676U5 607 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 OPN5Q6U736 354 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 ATCAYQ86WG3 371 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 VWA5B2Q8N398 1253 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM178AQ8NBL3 297 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 GALNT11Q8NCW6 608 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 DNAJB8Q8NHS0 232 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 MGARPQ8TDB4 240 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 DOK4Q8TEW6 326 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 C19orf60Q96EN9 201 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 EGLN2Q96KS0 407 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 C5orf34Q96MH7 638 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 OR10A5Q9H207 317 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 MANSC1Q9H8J5 431 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 ASF1BQ9NVP2 202 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 NTNG1Q9Y2I2 539 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 MYO1GB0I1T2 1018 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 KLF11O14901 512 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 SNNO75324 88 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 ATP6AP2O75787 350 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 SLITRK5O94991 958 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGEF1-204ENST00000442563 RASAL1O95294 804 aa15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms