RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436789.5

LRRC23-208, Transcript of leucine rich repeat containing 23, human

TSL 3 BASIC

Gene LRRC23, Length 796 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LRRC23-208	ENST00000436789	IL20RB	Q6UXL0	311 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	LRRC70	Q7Z2Q7	622 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	TRABD2A	Q86V40	505 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	CDC20B	Q86Y33	519 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	CCDC71	Q8IV32	467 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	TAGAP	Q8N103	731 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	TMEM151A	Q8N4L1	468 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	DTWD1	Q8N5C7	304 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	KCT2	Q8NC54	265 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	APCDD1L	Q8NCL9	501 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	NUBPL	Q8TB37	319 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	UBTD2	Q8WUN7	234 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	SLC5A11	Q8WWX8	675 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	EXT2	Q93063	718 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	UBE2E3	Q969T4	207 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	SCYL1	Q96KG9	808 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	ZIM3	Q96PE6	472 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	DEFB127	Q9H1M4	99 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	DLL4	Q9NR61	685 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	PRTFDC1	Q9NRG1	225 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	PNO1	Q9NRX1	252 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	PNPLA3	Q9NST1	481 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	DNAJC11	Q9NVH1	559 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	ZNF358	Q9NW07	568 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	ZNF226	Q9NYT6	803 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	WWOX	Q9NZC7	414 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	TMEM216	Q9P0N5	145 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	XPR1	Q9UBH6	696 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	SLC22A14	Q9Y267	594 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	PLEKHA6	Q9Y2H5	1048 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	RPH3A	Q9Y2J0	694 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	TNPO3	Q9Y5L0	923 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	PHF3	Q92576	2039 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	IGKV3D-11	A0A0A0MRZ8	115 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789		A0A0G2JNJ9	132 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	FEZF1	A0PJY2	475 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	GOLGA8R	I6L899	631 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	COPE	O14579	308 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	CLGN	O14967	610 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	SMPD2	O60906	423 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	CTNS	O60931	367 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	OR2J2	O76002	312 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	GLS	O94925	669 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	SNX4	O95219	450 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	EPPIN	O95925	133 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	SBK3	P0C264	359 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	C1GALT1C1L	P0DN25	315 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	CDH1	P12830	882 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	GFAP	P14136	432 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	EPB42	P16452	691 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	KRT4	P19013	534 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	TAC1	P20366	129 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	BMP5	P22003	454 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	CHM	P24386	653 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	GDF5	P43026	501 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	CPA2	P48052	419 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	PCYT1A	P49585	367 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	GPR143	P51810	404 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	MTTP	P55157	894 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	NRG3	P56975	720 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	RAB38	P57729	211 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	GPR85	P60893	370 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	PCDH1	Q08174	1060 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	LAPTM5	Q13571	262 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	E2F2	Q14209	437 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	FGFBP1	Q14512	234 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	CDSN	Q15517	529 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	PDK4	Q16654	411 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	PFKFB4	Q16877	469 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	C18orf21	Q32NC0	220 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	KRT71	Q3SY84	523 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	CCDC153	Q494R4	210 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	C6orf163	Q5TEZ5	329 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	NXPE4	Q6UWF7	544 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	SLCO4C1	Q6ZQN7	724 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	MILR1	Q7Z6M3	343 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	PLD3	Q8IV08	490 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	TMEM151B	Q8IW70	566 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	NFAM1	Q8NET5	270 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	OR52N2	Q8NGI0	321 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	OR5M9	Q8NGP3	310 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	TSLP	Q969D9	159 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	NEIL2	Q969S2	332 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	NCLN	Q969V3	563 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	ESAM	Q96AP7	390 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	WDR34	Q96EX3	536 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	RBM18	Q96H35	190 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
LRRC23-208	ENST00000436789	KCNC2	Q96PR1	638 aa		6.23	□□□□□ -1.41

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