RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa17.39■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 C19orf18Q8NEA5 215 aa17.39■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 C16orf78Q8WTQ4 265 aa17.39■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 HSPB11Q9Y547 144 aa17.39■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 KIAA1671Q9BY89 1806 aa17.38■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa17.38■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 HEPACAM2A8MVW5 462 aa17.38■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 LEUTXA8MZ59 168 aa17.38■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 H3BN98 237 aa17.38■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 MEN1O00255 615 aa17.38■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 SHOXO15266 292 aa17.38■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 TGM5O43548 720 aa17.38■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 FGF18O76093 207 aa17.38■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 POP4O95707 220 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM157BP0CG42 384 aa17.38■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 IFI30P13284 250 aa17.38■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 GSTM5P46439 218 aa17.38■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 TBPL1P62380 186 aa17.38■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 PDE7AQ13946 482 aa17.38■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP17.38■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 TRIQKQ629K1 86 aa17.38■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 CASP12Q6UXS9 341 aa17.38■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa17.38■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 CEACAM20Q6UY09 585 aa17.38■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 TCEANCQ8N8B7 351 aa17.38■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa17.38■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 KCTD7Q96MP8 289 aa17.38■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 MED18Q9BUE0 208 aa17.38■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 HDHD5Q9BXW7 423 aa17.38■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 KCNN3Q9UGI6 736 aa17.38■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 OBSL1O75147 1896 aa17.38■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 A0A1W2PRB8 838 aa17.38■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 KLK1P06870 262 aa17.38■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 LINC00271P0C7V0 271 aa17.38■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 GJA1P17302 382 aa17.38■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 IRS1P35568 1242 aa17.38■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 OPRD1P41143 372 aa17.38■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 PDZD3Q86UT5 571 aa17.38■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF480Q8WV37 535 aa17.38■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 KATNB1Q9BVA0 655 aa17.38■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 SPNS1Q9H2V7 528 aa17.38■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 NLKQ9UBE8 527 aa17.38■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 MOSPD1Q9UJG1 213 aa17.38■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 PRKAR1AP10644 381 aa17.37■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 GABRR2P28476 465 aa17.37■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 ETV5P41161 510 aa17.37■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 ETV1P50549 477 aa17.37■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 XKP51811 444 aa17.37■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 CLDN20P56880 219 aa17.37■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 WSCD2Q2TBF2 565 aa17.37■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 MPP7Q5T2T1 576 aa17.37■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF730Q6ZMV8 503 aa17.37■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 GAREM2Q75VX8 874 aa17.37■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 AMIGO1Q86WK6 493 aa17.37■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 Q8N402 240 aa17.37■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 NATD1Q8N6N6 113 aa17.37■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 IL17RCQ8NAC3 791 aa17.37■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 AP3S1Q92572 193 aa17.37■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 UPRTQ96BW1 309 aa17.37■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 ARPC5LQ9BPX5 153 aa17.37■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 SOSTQ9BQB4 213 aa17.37■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC6A16Q9GZN6 736 aa17.37■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 DMRT3Q9NQL9 472 aa17.37■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 MCUBQ9NWR8 336 aa17.37■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 HCN2Q9UL51 889 aa17.37■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 KIAA0355O15063 1070 aa17.37■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 OR10H3O60404 316 aa17.37■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 CTSAP10619 480 aa17.37■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 NPPBP16860 134 aa17.37■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 MYL12AP19105 171 aa17.37■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 DSTNP60981 165 aa17.37■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 RPS25P62851 125 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 HEPACAMQ14CZ8 416 aa17.37■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 OCLNQ16625 522 aa17.37■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 ATAT1Q5SQI0 421 aa17.37■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM71E1Q6IPT2 247 aa17.37■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 HTR3DQ70Z44 454 aa17.37■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 SYT14Q8NB59 555 aa17.37■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 OR52I1Q8NGK6 324 aa17.37■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 OR8J1Q8NGP2 316 aa17.37■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 LMLNQ96KR4 655 aa17.37■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 ZBP1Q9H171 429 aa17.37■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa17.37■□□□□ 0.37
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC23A1Q9UHI7 598 aa17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms