RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423339.2

CCDC82-202, Transcript of coiled-coil domain containing 82, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC82, Length 1,878 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82-202ENST00000423339 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 RNF215Q9Y6U7 377 aa2.58□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 LTBP4Q8N2S1 1624 aa2.58□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 CCDC144AA2RUR9 1427 aa2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 PTPRUQ92729 1446 aa2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 SETD5Q9C0A6 1442 aa2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 MROH2AA6NES4 1674 aa2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 ABCA6Q8N139 1617 aa2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 VWDEQ8N2E2 1590 aa2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 CFAP73A6NFT4 308 aa2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 PRPSAP2O60256 369 aa2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 KIAA0513O60268 411 aa2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 LYNP07948 512 aa2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 PCP11498 1178 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 AOC1P19801 751 aa2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 UGT1A4P22310 534 aa2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 FCGR2CP31995 323 aa2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 RPL9P32969 192 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 PITPNBP48739 271 aa2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 CDKL1Q00532 357 aa2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 MOGAT2Q3SYC2 334 aa2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 TEX35Q5T0J7 233 aa2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 TAF8Q7Z7C8 310 aa2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 LRRTM1Q86UE6 522 aa2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 WDR49Q8IV35 697 aa2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 KDM8Q8N371 416 aa2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 LEMD2Q8NC56 503 aa2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 PRSS33Q8NF86 280 aa2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 SPPL2AQ8TCT8 520 aa2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 RSPH1Q8WYR4 309 aa2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 PCED1BQ96HM7 432 aa2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 CXorf58Q96LI9 332 aa2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 LINC00479Q96M42 142 aa2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 NSMCE2Q96MF7 247 aa2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF599Q96NL3 588 aa2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 AGAP4Q96P64 663 aa2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 DCTN5Q9BTE1 182 aa2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 FTHL17Q9BXU8 183 aa2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 SLC26A1Q9H2B4 701 aa2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 NMUR1Q9HB89 426 aa2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 NINJ2Q9NZG7 142 aa2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 VPS54Q9P1Q0 977 aa2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 FAM153AQ9UHL3 310 aa2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 EFCAB6Q5THR3 1501 aa2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 LRRC7Q96NW7 1537 aa2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 ADGBQ8N7X0 1667 aa2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 DEPDC5O75140 1603 aa2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa2.57□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 YJEFN3A6XGL0 299 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 LRP3O75074 770 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 ETS1P14921 441 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 NUMBP49757 651 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 LIMK2P53671 638 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 RBBP4Q09028 425 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 CCDC40Q4G0X9 1142 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 GPAT3Q53EU6 434 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 NEPROQ6NW34 567 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 FAAP20Q6NZ36 180 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF613Q6PF04 617 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF730Q6ZMV8 503 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 ITIH5Q86UX2 942 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 SLC22A16Q86VW1 577 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 TBC1D10CQ8IV04 446 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 METTL4Q8N3J2 472 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 CNNM3Q8NE01 707 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 OR52B6Q8NGF0 335 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 P3H4Q92791 437 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 ESAMQ96AP7 390 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 MOCOSQ96EN8 888 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 C14orf79Q96F83 325 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 RUNDC3BQ96NL0 473 aa2.56□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.8 ms