RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394202.8

CNN3-202, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CNN3, Length 1,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-202ENST00000394202 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 TRIML2Q8N7C3 387 aa21.81■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 TSLPQ969D9 159 aa21.81■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 PTCHD1Q96NR3 888 aa21.81■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 DCHS1Q96JQ0 3298 aa21.81■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 ATP1B1P05026 303 aa21.8■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 GPX2P18283 190 aa21.8■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 OR4D2P58180 307 aa21.8■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 RPS26P62854 115 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 C3orf38Q5JPI3 329 aa21.8■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 CPZQ66K79 652 aa21.8■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa21.8■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 RNF130Q86XS8 419 aa21.8■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 OR7G2Q8NG99 324 aa21.8■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 STT3BQ8TCJ2 826 aa21.8■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 SH3GL1Q99961 368 aa21.8■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 SATB2Q9UPW6 733 aa21.8■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa21.79■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 BLACEA4D250 179 aa21.79■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 C9orf172C9J069 976 aa21.79■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 DNAJA2O60884 412 aa21.79■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 ONECUT2O95948 504 aa21.79■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 RECKO95980 971 aa21.79■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 CT62P0C5K7 136 aa21.79■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 SLC35E2P0CK97 266 aa21.79■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 HSD17B1P14061 328 aa21.79■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 RHAGQ02094 409 aa21.79■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 MGAT2Q10469 447 aa21.79■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 RGNQ15493 299 aa21.79■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 SPDYE7PQ495Y7 208 aa21.79■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 SAXO2Q658L1 398 aa21.79■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 C6orf120Q7Z4R8 191 aa21.79■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 CALHM3Q86XJ0 350 aa21.79■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 GALNT6Q8NCL4 622 aa21.79■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 TAAR9Q96RI9 348 aa21.79■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 VN1R1Q9GZP7 353 aa21.79■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 EGFL7Q9UHF1 273 aa21.79■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 GMEB1Q9Y692 573 aa21.79■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 EVPLLA8MZ36 301 aa21.79■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 NUDT7P0C024 238 aa21.79■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 RAB15P59190 212 aa21.79■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 ZNF628Q5EBL2 1059 aa21.79■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 OVCH1Q7RTY7 1134 aa21.79■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 SZRD1Q7Z422 152 aa21.79■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 TGIF2Q9GZN2 237 aa21.79■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 MKL2Q9ULH7 1088 aa21.79■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa21.78■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 UPK1AO00322 258 aa21.78■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 ZGLP1P0C6A0 271 aa21.78■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 ETFAP13804 333 aa21.78■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 NT5EP21589 574 aa21.78■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 PRKAG1P54619 331 aa21.78■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 TP53BP2Q13625 1128 aa21.78■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa21.78■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 FAM69BQ5VUD6 431 aa21.78■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 MLIPQ5VWP3 458 aa21.78■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 NEURL3Q96EH8 262 aa21.78■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 MESP1Q9BRJ9 268 aa21.78■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 CHST8Q9H2A9 424 aa21.78■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 SERHL2Q9H4I8 314 aa21.78■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 SEMA3GQ9NS98 782 aa21.78■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 CCDC88CQ9P219 2028 aa21.78■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 ACOT8O14734 319 aa21.78■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 SLC30A4O14863 429 aa21.78■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 STK17BO94768 372 aa21.78■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 IL10P22301 178 aa21.78■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 ADRM1Q16186 407 aa21.78■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 QSOX2Q6ZRP7 698 aa21.78■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 MAT2BQ9NZL9 334 aa21.78■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 FOXJ2Q9P0K8 574 aa21.78■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 HRKO00198 91 aa21.77■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 OR10H2O60403 315 aa21.77■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 KCNK5O95279 499 aa21.77■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 CRATP43155 626 aa21.77■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 NKG7Q16617 165 aa21.77■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 C1orf146Q5VVC0 180 aa21.77■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 LRFN5Q96NI6 719 aa21.77■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 MMACHCQ9Y4U1 282 aa21.77■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 NCK1P16333 377 aa21.76■■□□□ 1.07
CNN3-202ENST00000394202 OCA2Q04671 838 aa21.76■■□□□ 1.07
CNN3-202ENST00000394202 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
CNN3-202ENST00000394202 FHL5Q5TD97 284 aa21.76■■□□□ 1.07
CNN3-202ENST00000394202 TMEM64Q6YI46 380 aa21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms