RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393150.7

CASP4-201, Transcript of caspase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CASP4, Length 1,340 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4-201ENST00000393150 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa7.22□□□□□ -1.25
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CASP4-201ENST00000393150 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CASP4-201ENST00000393150 LPAR3Q9UBY5 353 aa7.22□□□□□ -1.25
CASP4-201ENST00000393150 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa7.22□□□□□ -1.25
CASP4-201ENST00000393150 TCAF1Q9Y4C2 921 aa7.22□□□□□ -1.25
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CASP4-201ENST00000393150 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
CASP4-201ENST00000393150 SAT1P21673 171 aa7.21□□□□□ -1.26
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CASP4-201ENST00000393150 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
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CASP4-201ENST00000393150 CSHL1Q14406 222 aa7.21□□□□□ -1.26
CASP4-201ENST00000393150 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP7.21□□□□□ -1.26
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CASP4-201ENST00000393150 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
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CASP4-201ENST00000393150 REXO1L1PQ8IX06 675 aa7.21□□□□□ -1.26
CASP4-201ENST00000393150 ZNF595Q8IYB9 648 aa7.21□□□□□ -1.26
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CASP4-201ENST00000393150 OR8K3Q8NH51 312 aa7.21□□□□□ -1.26
CASP4-201ENST00000393150 OR14A16Q8NHC5 309 aa7.21□□□□□ -1.26
CASP4-201ENST00000393150 KIAA1191Q96A73 305 aa7.21□□□□□ -1.26
CASP4-201ENST00000393150 FAM136AQ96C01 138 aa7.21□□□□□ -1.26
CASP4-201ENST00000393150 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
CASP4-201ENST00000393150 SCYL1Q96KG9 808 aa7.21□□□□□ -1.26
CASP4-201ENST00000393150 RUNDC3BQ96NL0 473 aa7.21□□□□□ -1.26
CASP4-201ENST00000393150 FAM111AQ96PZ2 611 aa7.21□□□□□ -1.26
CASP4-201ENST00000393150 KRT12Q99456 494 aa7.21□□□□□ -1.26
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CASP4-201ENST00000393150 OR8D2Q9GZM6 311 aa7.21□□□□□ -1.26
CASP4-201ENST00000393150 P2RY12Q9H244 342 aa7.21□□□□□ -1.26
CASP4-201ENST00000393150 HSD3B7Q9H2F3 369 aa7.21□□□□□ -1.26
CASP4-201ENST00000393150 FANCFQ9NPI8 374 aa7.21□□□□□ -1.26
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CASP4-201ENST00000393150 BFARQ9NZS9 450 aa7.21□□□□□ -1.26
CASP4-201ENST00000393150 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
CASP4-201ENST00000393150 KLHL42Q9P2K6 505 aa7.21□□□□□ -1.26
CASP4-201ENST00000393150 SPRR3Q9UBC9 169 aa7.21□□□□□ -1.26
CASP4-201ENST00000393150 CRYL1Q9Y2S2 319 aa7.21□□□□□ -1.26
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CASP4-201ENST00000393150 TP53I11O14683 189 aa7.2□□□□□ -1.26
CASP4-201ENST00000393150 PJA2O43164 708 aa7.2□□□□□ -1.26
CASP4-201ENST00000393150 CTIFO43310 598 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CASP4-201ENST00000393150 B3GALT2O43825 422 aa7.2□□□□□ -1.26
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CASP4-201ENST00000393150 NIPSNAP2O75323 286 aa7.2□□□□□ -1.26
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CASP4-201ENST00000393150 TBPL1P62380 186 aa7.2□□□□□ -1.26
CASP4-201ENST00000393150 ACVR1Q04771 509 aa7.2□□□□□ -1.26
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CASP4-201ENST00000393150 ZNF597Q96LX8 424 aa7.2□□□□□ -1.26
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CASP4-201ENST00000393150 TIMP4Q99727 224 aa7.2□□□□□ -1.26
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