RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 ATG4BQ9Y4P1 393 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 AFF2P51816 1311 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 ABCA7Q8IZY2 2146 aa2.15□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRIM49BA6NDI0 452 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARHGAP42A6NI28 874 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 MCF2LO15068 1137 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 NME2P1O60361 137 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 LRP3O75074 770 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 RENP00797 406 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 MT-ND3P03897 115 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 APRTP07741 180 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCDC159P0C7I6 412 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 HSD17B1P14061 328 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 FOLR2P14207 255 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 STMN1P16949 149 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 AHCYP23526 432 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 MATKP42679 507 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 TAF6P49848 677 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCL11P51671 97 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 SSTP61278 116 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 LMO4P61968 165 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 CARTPTQ16568 116 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 PCK2Q16822 640 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 CMPK2Q5EBM0 449 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 SEL1L3Q68CR1 1132 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 LEMD1Q68G75 181 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 BNIPLQ7Z465 357 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 GPR142Q7Z601 462 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 P2RY8Q86VZ1 359 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 LYG1Q8N1E2 194 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 KIAA1524Q8TCG1 905 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 WBP1Q96G27 269 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 PYGO2Q9BRQ0 406 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 DCTPP1Q9H773 170 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 Q9HAA7 133 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 SYTL2Q9HCH5 934 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANO10Q9NW15 660 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 FETUBQ9UGM5 382 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 ENTPD4Q9Y227 616 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC6A5Q9Y345 797 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 KIF7Q2M1P5 1343 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 CFLARO15519 480 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP2.14□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 SEMA4FO95754 770 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC4A1P02730 911 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 CXCL10P02778 98 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 ALPPP05187 535 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCDC192P0DO97 292 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 ALPPL2P10696 532 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP2.14□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 SFNP31947 248 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 PTGER3P43115 390 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRELPP51888 382 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC7A2P52569 658 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP2.14□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 DSCR10P59022 87 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 WASHC5Q12768 1159 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 NME3Q13232 169 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP2.14□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCL14Q16627 93 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP2.14□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 HKDC1Q2TB90 917 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 CNPY1Q3B7I2 92 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANKRD55Q3KP44 614 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCDC40Q4G0X9 1142 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP2.14□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 RHBDD2Q6NTF9 364 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 PLBD1Q6P4A8 553 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 RFWD3Q6PCD5 774 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 REG3GQ6UW15 175 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 MOB2Q70IA6 237 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 MIER3Q7Z3K6 550 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 LUZP1Q86V48 1076 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 CDC20BQ86Y33 519 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 MLKLQ8NB16 471 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCNYQ8ND76 341 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR52E1Q8NGJ3 308 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 ITLN1Q8WWA0 313 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC13A3Q8WWT9 602 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 CAPNS2Q96L46 248 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 ACCSQ96QU6 501 aa2.14□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms