RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328020.10

CMTM1-201, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM1, Length 981 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1-201ENST00000328020 CLMPQ9H6B4 373 aa13.15□□□□□ -0.3
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CMTM1-201ENST00000328020 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
CMTM1-201ENST00000328020 KCNMB2Q9Y691 235 aa13.15□□□□□ -0.3
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CMTM1-201ENST00000328020 OR1N1Q8NGS0 311 aa13.14□□□□□ -0.31
CMTM1-201ENST00000328020 SLC2A12Q8TD20 617 aa13.14□□□□□ -0.31
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CMTM1-201ENST00000328020 NEUROD4Q9HD90 331 aa13.14□□□□□ -0.31
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CMTM1-201ENST00000328020 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
CMTM1-201ENST00000328020 MED13Q9UHV7 2174 aa13.14□□□□□ -0.31
CMTM1-201ENST00000328020 ZFHX4Q86UP3 3567 aa13.14□□□□□ -0.31
CMTM1-201ENST00000328020 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa13.13□□□□□ -0.31
CMTM1-201ENST00000328020 MKRN2OSH3BPM6 223 aa13.13□□□□□ -0.31
CMTM1-201ENST00000328020 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
CMTM1-201ENST00000328020 CFLARO15519 480 aa13.13□□□□□ -0.31
CMTM1-201ENST00000328020 SNX3O60493 162 aa13.13□□□□□ -0.31
CMTM1-201ENST00000328020 PRAMEF2O60811 474 aa13.13□□□□□ -0.31
CMTM1-201ENST00000328020 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
CMTM1-201ENST00000328020 COQ9O75208 318 aa13.13□□□□□ -0.31
CMTM1-201ENST00000328020 ZFAND5O76080 213 aa13.13□□□□□ -0.31
CMTM1-201ENST00000328020 PGRP06401 933 aa13.13□□□□□ -0.31
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CMTM1-201ENST00000328020 FRKP42685 505 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
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CMTM1-201ENST00000328020 AGAP4Q96P64 663 aa13.13□□□□□ -0.31
CMTM1-201ENST00000328020 OR52E6Q96RD3 313 aa13.13□□□□□ -0.31
CMTM1-201ENST00000328020 GLIPR2Q9H4G4 154 aa13.13□□□□□ -0.31
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CMTM1-201ENST00000328020 C3orf14Q9HBI5 128 aa13.13□□□□□ -0.31
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CMTM1-201ENST00000328020 PTGFRNQ9P2B2 879 aa13.13□□□□□ -0.31
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CMTM1-201ENST00000328020 ERVK-19Q9WJR5 959 aa13.13□□□□□ -0.31
CMTM1-201ENST00000328020 CACNA1BQ00975 2339 aa13.13□□□□□ -0.31
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CMTM1-201ENST00000328020 DOCK10Q96BY6 2186 aa13.13□□□□□ -0.31
CMTM1-201ENST00000328020 MGAQ8IWI9 3026 aa13.13□□□□□ -0.31
CMTM1-201ENST00000328020 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
CMTM1-201ENST00000328020 A0A087WV62 115 aa13.12□□□□□ -0.31
CMTM1-201ENST00000328020 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa13.12□□□□□ -0.31
CMTM1-201ENST00000328020 PLOD2O00469 737 aa13.12□□□□□ -0.31
CMTM1-201ENST00000328020 SLC22A2O15244 555 aa13.12□□□□□ -0.31
CMTM1-201ENST00000328020 PLOD3O60568 738 aa13.12□□□□□ -0.31
CMTM1-201ENST00000328020 DDAH2O95865 285 aa13.12□□□□□ -0.31
CMTM1-201ENST00000328020 FAM107AO95990 144 aa13.12□□□□□ -0.31
CMTM1-201ENST00000328020 GPX3P22352 226 aa13.12□□□□□ -0.31
CMTM1-201ENST00000328020 FUT7Q11130 342 aa13.12□□□□□ -0.31
CMTM1-201ENST00000328020 HSPB3Q12988 150 aa13.12□□□□□ -0.31
CMTM1-201ENST00000328020 MYBPC3Q14896 1274 aa13.12□□□□□ -0.31
CMTM1-201ENST00000328020 MAPRE2Q15555 327 aa13.12□□□□□ -0.31
CMTM1-201ENST00000328020 TBR1Q16650 682 aa13.12□□□□□ -0.31
CMTM1-201ENST00000328020 SPDYE7PQ495Y7 208 aa13.12□□□□□ -0.31
CMTM1-201ENST00000328020 AGKQ53H12 422 aa13.12□□□□□ -0.31
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