RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 GPR155Q7Z3F1 870 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 KMT5CQ86Y97 462 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 PDSS2Q86YH6 399 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 C10orf111Q8N326 155 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 METTL25Q8N6Q8 603 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM105Q8N8V8 129 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 OR56A1Q8NGH5 318 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 OR4C6Q8NH72 309 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 SFXN5Q8TD22 340 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 SAP25Q8TEE9 199 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 UCN3Q969E3 161 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM117AQ9C073 453 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 EPS8L2Q9H6S3 715 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 GAREM1Q9H706 876 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 SLAMF7Q9NQ25 335 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 GPATCH2Q9NW75 528 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 ANGPT4Q9Y264 503 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 SPAG17Q6Q759 2223 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 HYKKA2RU49 373 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 CLDN4O14493 209 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 EMC8O43402 210 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 GPR75O95800 540 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 CER1O95813 267 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 FHP07954 510 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 GIMD1P0DJR0 217 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 C8orf89P0DMQ9 161 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 PORP16435 677 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 CD1CP29017 333 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 PPP2R1BP30154 601 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 DSTNP60981 165 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 SQSTM1Q13501 440 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 SCARB2Q14108 478 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 GRM7Q14831 915 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 MYBPC3Q14896 1274 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP9.52□□□□□ -0.899e-54■■■■■ 28.8
RABGGTB-201ENST00000319942 COX20Q5RI15 118 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 REEP3Q6NUK4 255 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 PPP4R4Q6NUP7 873 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 ENPP6Q6UWR7 440 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 USP53Q70EK8 1073 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 CBLL1Q75N03 491 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 SZRD1Q7Z422 152 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 GATAD2AQ86YP4 633 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 GALNT4Q8N4A0 578 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 PACRGLQ8N7B6 248 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM181AQ8N9Y4 354 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF681Q96N22 645 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF285Q96NJ3 590 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 TRIM4Q9C037 500 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 CHST8Q9H2A9 424 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 COQ10BQ9H8M1 238 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 STARD5Q9NSY2 213 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 DNAJB9Q9UBS3 223 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 KLHL3Q9UH77 587 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 SERTAD3Q9UJW9 196 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 LRCH1Q9Y2L9 728 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 V9GYQ6 96 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 CPED1A4D0V7 1026 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 DUXAA6NLW8 204 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 M0QX08 132 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 CHST10O43529 356 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 CST1P01037 141 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 C9P02748 559 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 RNH1P13489 461 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 CPMP14384 443 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 MATN1P21941 496 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 CDK9P50750 372 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 ARHGDIAP52565 204 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 PRKAG1P54619 331 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 CASP9P55211 416 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 GFERP55789 205 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 RAB38P57729 211 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 SELENOWP63302 87 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 C16orf72Q14CZ0 275 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 DEFB110Q30KQ9 67 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 CRB2Q5IJ48 1285 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM71Q6P5X7 295 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC23A3Q6PIS1 610 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC80Q76M96 950 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 GPR135Q8IZ08 494 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 CA13Q8N1Q1 262 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 NAT6Q93015 286 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 MAL2Q969L2 176 aa9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms