RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000288022.1

PDF-201, Transcript of peptide deformylase, mitochondrial, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDF, Length 1,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDF-201ENST00000288022 OR6B1O95007 311 aa23.3■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 CBX6O95503 412 aa23.3■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 HSPA4LO95757 839 aa23.3■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 CT62P0C5K7 136 aa23.3■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 NME2P22392 152 aa23.3■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 ARRB2P32121 409 aa23.3■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 PTGER1P34995 402 aa23.3■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 SLC37A1P57057 533 aa23.3■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 C2orf80Q0P641 193 aa23.3■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 NOXRED1Q6NXP6 359 aa23.3■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 ZNF227Q86WZ6 799 aa23.3■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa23.3■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 ANKRD42Q8N9B4 389 aa23.3■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 GIMAP4Q9NUV9 329 aa23.3■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 ENTPD4Q9Y227 616 aa23.3■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 OR6C76A6NM76 312 aa23.29■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 ATP1B1P05026 303 aa23.29■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 SERPINE1P05121 402 aa23.29■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 PRPH2P23942 346 aa23.29■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 MPP2Q14168 576 aa23.29■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 CASP8Q14790 479 aa23.29■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 RNF165Q6ZSG1 346 aa23.29■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 VWA5B2Q8N398 1253 aa23.29■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 OR6Y1Q8NGX8 325 aa23.29■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 OR2T11Q8NH01 316 aa23.29■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 DNAJB8Q8NHS0 232 aa23.29■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 SLC22A8Q8TCC7 542 aa23.29■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 NR4A3Q92570 626 aa23.29■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa23.29■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 MIEF1Q9NQG6 463 aa23.29■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 PIP5K1BO14986 540 aa23.28■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 CLPSP04118 112 aa23.28■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 EDN3P14138 238 aa23.28■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 DUSP2Q05923 314 aa23.28■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 MPEG1Q2M385 716 aa23.28■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 GALNTL6Q49A17 601 aa23.28■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 HHATQ5VTY9 493 aa23.28■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa23.28■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 OPN5Q6U736 354 aa23.28■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 Q6ZSR9 355 aa23.28■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa23.28■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 ADCY4Q8NFM4 1077 aa23.28■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 PRR7Q8TB68 274 aa23.28■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 ZNF681Q96N22 645 aa23.28■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 SLX1AQ9BQ83 275 aa23.28■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 WWTR1Q9GZV5 400 aa23.28■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 OR10A5Q9H207 317 aa23.28■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 MYNNQ9NPC7 610 aa23.28■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa23.28■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 BAHCC1Q9P281 2608 aa23.27■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 TMEM114B3SHH9 223 aa23.27■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 DHRS4L1P0CG22 281 aa23.27■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 DDCP20711 480 aa23.27■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 RPL38P63173 70 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 FUT7Q11130 342 aa23.27■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 EBPQ15125 230 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 LTB4RQ15722 352 aa23.27■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa23.27■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 UGT3A2Q3SY77 523 aa23.27■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 PIGGQ5H8A4 983 aa23.27■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 FAM111BQ6SJ93 734 aa23.27■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 MDGA2Q7Z553 956 aa23.27■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 CCDC116Q8IYX3 515 aa23.27■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 OR7G1Q8NGA0 311 aa23.27■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 TMBIM4Q9HC24 238 aa23.27■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 MAT2BQ9NZL9 334 aa23.27■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 EHD3Q9NZN3 535 aa23.27■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 BCAP29Q9UHQ4 241 aa23.27■■□□□ 1.32
PDF-201ENST00000288022 TENM4Q6N022 2769 aa23.26■■□□□ 1.31
PDF-201ENST00000288022 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa23.26■■□□□ 1.31
PDF-201ENST00000288022 TMEM120BA0PK00 339 aa23.26■■□□□ 1.31
PDF-201ENST00000288022 NPIPB8E9PQR5 432 aa23.26■■□□□ 1.31
PDF-201ENST00000288022 ITM2AO43736 263 aa23.26■■□□□ 1.31
PDF-201ENST00000288022 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
PDF-201ENST00000288022 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
PDF-201ENST00000288022 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
PDF-201ENST00000288022 MAP4K2Q12851 820 aa23.26■■□□□ 1.31
PDF-201ENST00000288022 KIAA0040Q15053 153 aa23.26■■□□□ 1.31
PDF-201ENST00000288022 CES4AQ5XG92 561 aa23.26■■□□□ 1.31
PDF-201ENST00000288022 FAM71E1Q6IPT2 247 aa23.26■■□□□ 1.31
PDF-201ENST00000288022 RTL4Q6ZR62 310 aa23.26■■□□□ 1.31
PDF-201ENST00000288022 TICAM1Q8IUC6 712 aa23.26■■□□□ 1.31
PDF-201ENST00000288022 FRMD6Q96NE9 622 aa23.26■■□□□ 1.31
PDF-201ENST00000288022 BBS4Q96RK4 519 aa23.26■■□□□ 1.31
PDF-201ENST00000288022 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa23.26■■□□□ 1.31
PDF-201ENST00000288022 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
PDF-201ENST00000288022 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms