RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 AGAP6Q5VW22 663 aa26.5■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 COX14Q96I36 57 aa26.5■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 AGAP4Q96P64 663 aa26.5■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 BARHL1Q9BZE3 327 aa26.5■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 ERVK13-1Q9NX77 482 aa26.5■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 TAS2R7Q9NYW3 318 aa26.5■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 A4GNTQ9UNA3 340 aa26.5■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 NINQ8N4C6 2090 aa26.5■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 C5orf67F2Z3F1 127 aa26.5■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 MYL12BO14950 172 aa26.5■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 NDUFS4O43181 175 aa26.5■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 NME6O75414 186 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 TP53P04637 393 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 COPZ1P61923 177 aa26.5■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 KIAA1211LQ6NV74 962 aa26.5■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 TBC1D19Q8N5T2 526 aa26.5■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 SSR3Q9UNL2 185 aa26.5■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 SLC35F4A4IF30 521 aa26.49■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 HEPACAM2A8MVW5 462 aa26.49■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 TPST2O60704 377 aa26.49■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 HBQ1P09105 142 aa26.49■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 PPP2R1BP30154 601 aa26.49■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 RUNX1T1Q06455 604 aa26.49■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 SPRED2Q7Z698 418 aa26.49■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 SLC35G5Q96KT7 338 aa26.49■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 SERHL2Q9H4I8 314 aa26.49■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 C5AR2Q9P296 337 aa26.49■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 HCN2Q9UL51 889 aa26.49■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa26.48■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 TCEAL5Q5H9L2 206 aa26.48■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa26.48■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 OR8H2Q8N162 312 aa26.48■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa26.48■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 NXPE3Q969Y0 559 aa26.48■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 OR2A14Q96R47 310 aa26.48■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 C14orf119Q9NWQ9 140 aa26.48■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa26.48■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa26.48■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 PRKAB1Q9Y478 270 aa26.48■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 DENND4AQ7Z401 1863 aa26.48■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 H3BQ06 376 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 RGS5O15539 181 aa26.48■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 TMPRSS11DO60235 418 aa26.48■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 EN2P19622 333 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa26.48■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa26.48■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa26.48■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 TBC1D24Q9ULP9 559 aa26.48■■□□□ 1.83
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UBP1-201ENST00000283628 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa26.48■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 V9GYH0 126 aa26.48■■□□□ 1.83
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UBP1-201ENST00000283628 SYPL1Q16563 259 aa26.47■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 ZNF544Q6NX49 715 aa26.47■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 PODNL1Q6PEZ8 512 aa26.47■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 PHC2Q8IXK0 858 aa26.47■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 CXorf40AQ8TE69 158 aa26.47■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 ASB15Q8WXK1 588 aa26.47■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 FNDC11Q9BVV2 318 aa26.47■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 OR51I1Q9H343 314 aa26.47■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 TVP23BQ9NYZ1 205 aa26.47■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa26.47■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 PRRT4C9JH25 899 aa26.46■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 RAB36O95755 333 aa26.46■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 OR12D1P0DN82 309 aa26.46■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 DRD2P14416 443 aa26.46■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 TNNI3P19429 210 aa26.46■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 PSPHP78330 225 aa26.46■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 LRRTM4Q86VH4 590 aa26.46■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 WFDC6Q9BQY6 131 aa26.46■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 MENTQ9BUN1 341 aa26.46■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 MVB12BQ9H7P6 319 aa26.46■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 FEZF1A0PJY2 475 aa26.46■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 NR2F1P10589 423 aa26.46■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 CEBPBP17676 345 aa26.46■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 METRNLQ641Q3 311 aa26.46■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 BBS10Q8TAM1 723 aa26.46■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 LRRC3BQ96PB8 259 aa26.46■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 SNTG1Q9NSN8 517 aa26.46■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 SLC23A2Q9UGH3 650 aa26.46■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa26.45■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 H7BY64 318 aa26.45■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 CCNKO75909 580 aa26.45■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 ACADMP11310 421 aa26.45■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 OR2B6P58173 313 aa26.45■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa26.45■■□□□ 1.83
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