RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281171.8

PTPRO-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,301 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-201ENST00000281171 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa13.76□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa13.76□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 FAM217AQ8IXS0 508 aa13.76□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa13.76□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 OR2AP1Q8NGE2 309 aa13.76□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 ADAMTS15Q8TE58 950 aa13.76□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 NT5C3BQ969T7 300 aa13.76□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 FBXO8Q9NRD0 319 aa13.76□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 LRFN1Q9P244 771 aa13.76□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 NALCNQ8IZF0 1738 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 SLC35F4A4IF30 521 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 NPC1O15118 1278 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 TGOLN2O43493 480 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 BEST1O76090 585 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 RD3LP0DJH9 198 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 RPL10P27635 214 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 ASPAP45381 313 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 AVPR1BP47901 424 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 RSU1Q15404 277 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 BRINP2Q9C0B6 783 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 SFTPBP07988 381 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 RAB6AP20340 208 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 CLCNKBP51801 687 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 LRIF1Q5T3J3 769 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 ZER1Q7Z7L7 766 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 SLC25A36Q96CQ1 311 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 SOX14O95416 240 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 OR8U9P0C7N5 309 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 FCN2Q15485 313 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 POC1BQ8TC44 478 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 COL26A1Q96A83 441 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 SLC22A18Q96BI1 424 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 CAPNS2Q96L46 248 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 PKP4Q99569 1192 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 MICU1Q9BPX6 476 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 SLC6A16Q9GZN6 736 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 SCML2Q9UQR0 700 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 OR6C6A6NF89 314 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 IMPA2O14732 288 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 TXNDC12O95881 172 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 GJB1P08034 283 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 GGT1P19440 569 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 IGFBP4P22692 258 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 PAX6P26367 422 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 S100A11P31949 105 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 KCNJ5P48544 419 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 CRISP1P54107 249 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 TMEM205Q6UW68 189 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 SYT14Q8NB59 555 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 OR56B4Q8NH76 319 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 C14orf79Q96F83 325 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 RANBP9Q96S59 729 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 PKMYT1Q99640 499 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 RNF11Q9Y3C5 154 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 AGAP14A8MT82 685 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 IL1AP01583 271 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 OPN1SWP03999 348 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 CBSLP0DN79 551 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 CBSP35520 551 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 OR4D2P58180 307 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 PLPP4Q5VZY2 271 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 RASGRP3Q8IV61 690 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 OR10H5Q8NGA6 315 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 OR6M1Q8NGM8 313 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 DCUN1D4Q92564 292 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 FKBP10Q96AY3 582 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 GPATCH2Q9NW75 528 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 CPED1A4D0V7 1026 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 A8MVJ9 347 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 D6RAR5 112 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 NME4O00746 187 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 ITGAMP11215 1152 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 CTRB1P17538 263 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 ZP3P21754 424 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 TEKQ02763 1124 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 GNMTQ14749 295 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 TRAM2Q15035 370 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 CTRB2Q6GPI1 263 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 EBPLQ9BY08 206 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 OR51I1Q9H343 314 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 KIF25Q9UIL4 384 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 FZD1Q9UP38 647 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 TBC1D3EA0A087X179 549 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 A0A096LPI6 279 aa13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.6 ms