RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 RPL38P63173 70 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
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SYF2-201ENST00000236273 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 GALNTL6Q49A17 601 aa20.68■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 C6orf136Q5SQH8 315 aa20.68■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 SPINK14Q6IE38 97 aa20.68■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 FAM111BQ6SJ93 734 aa20.68■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 ZNF615Q8N8J6 731 aa20.68■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 SIMC1Q8NDZ2 872 aa20.68■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 SUN3Q8TAQ9 357 aa20.68■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 CTHRC1Q96CG8 243 aa20.68■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
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SYF2-201ENST00000236273 CCT7Q99832 543 aa20.68■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 CNPPD1Q9BV87 410 aa20.68■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 TRIM4Q9C037 500 aa20.68■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa20.68■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 MAT2BQ9NZL9 334 aa20.68■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa20.68■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 RELNP78509 3460 aa20.67■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 TRAV17A0A0B4J275 112 aa20.67■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa20.67■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 CDK2AP1O14519 115 aa20.67■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 PEX11AO75192 247 aa20.67■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 SSTR4P31391 388 aa20.67■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 DUSP8Q13202 625 aa20.67■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
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SYF2-201ENST00000236273 GALNT12Q8IXK2 581 aa20.67■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 CCDC116Q8IYX3 515 aa20.67■□□□□ 0.9
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SYF2-201ENST00000236273 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 PPP3R2Q96LZ3 170 aa20.67■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 HES7Q9BYE0 225 aa20.67■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP20.67■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa20.67■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 TMED5Q9Y3A6 229 aa20.67■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 WWP2O00308 870 aa20.66■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 OR2J2O76002 312 aa20.66■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 BCKDHAP12694 445 aa20.66■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 NT5EP21589 574 aa20.66■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 HLCSP50747 726 aa20.66■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 OR1C1Q15619 314 aa20.66■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 LTB4RQ15722 352 aa20.66■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 IGFBP7Q16270 282 aa20.66■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 IKBIPQ70UQ0 350 aa20.66■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 ADCY4Q8NFM4 1077 aa20.66■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 NUBPLQ8TB37 319 aa20.66■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 CPT1CQ8TCG5 803 aa20.66■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 SCMH1Q96GD3 660 aa20.66■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 ART5Q96L15 291 aa20.66■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 MANSC1Q9H8J5 431 aa20.66■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 THAP1Q9NVV9 213 aa20.66■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 COPS7AQ9UBW8 275 aa20.66■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa20.66■□□□□ 0.9
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SYF2-201ENST00000236273 FOXK1P85037 733 aa20.65■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 OCRLQ01968 901 aa20.65■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 EBPQ15125 230 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 ZNF628Q5EBL2 1059 aa20.65■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 PIGGQ5H8A4 983 aa20.65■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 ZNF441Q8N8Z8 693 aa20.65■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 CDC26Q8NHZ8 85 aa20.65■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa20.65■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 TSSK3Q96PN8 268 aa20.65■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 TAAR6Q96RI8 345 aa20.65■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 RASL10BQ96S79 203 aa20.65■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 LRFN1Q9P244 771 aa20.65■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 ABI3Q9P2A4 366 aa20.65■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa20.65■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 FCHO1O14526 889 aa20.64■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 CBX7O95931 251 aa20.64■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 CYB561P49447 251 aa20.64■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 MPEG1Q2M385 716 aa20.64■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 ZNF385BQ569K4 471 aa20.64■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 LYPD8Q6UX82 237 aa20.64■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 RNF111Q6ZNA4 994 aa20.64■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 OR5L2Q8NGL0 311 aa20.64■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 CLHC1Q8NHS4 586 aa20.64■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 OR10A5Q9H207 317 aa20.64■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 AKTIPQ9H8T0 292 aa20.64■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 ASF1BQ9NVP2 202 aa20.64■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 KLF11O14901 512 aa20.63■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 TBX19O60806 448 aa20.63■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 PDE7AQ13946 482 aa20.63■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa20.63■□□□□ 0.89
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