RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229304.4

APOBEC1-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC1, Length 879 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1-201ENST00000229304 RAB38P57729 211 aa8.97□□□□□ -0.97
APOBEC1-201ENST00000229304 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
APOBEC1-201ENST00000229304 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
APOBEC1-201ENST00000229304 DUSP2Q05923 314 aa8.97□□□□□ -0.97
APOBEC1-201ENST00000229304 TP53BP2Q13625 1128 aa8.97□□□□□ -0.97
APOBEC1-201ENST00000229304 FAM53BQ14153 422 aa8.97□□□□□ -0.97
APOBEC1-201ENST00000229304 SHBQ15464 509 aa8.97□□□□□ -0.97
APOBEC1-201ENST00000229304 MAPK11Q15759 364 aa8.97□□□□□ -0.97
APOBEC1-201ENST00000229304 NDUFA9Q16795 377 aa8.97□□□□□ -0.97
APOBEC1-201ENST00000229304 RFX4Q33E94 735 aa8.97□□□□□ -0.97
APOBEC1-201ENST00000229304 TCTE1Q5JU00 501 aa8.97□□□□□ -0.97
APOBEC1-201ENST00000229304 PMS2CLQ68D20 193 aa8.97□□□□□ -0.97
APOBEC1-201ENST00000229304 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
APOBEC1-201ENST00000229304 TBPL2Q6SJ96 375 aa8.97□□□□□ -0.97
APOBEC1-201ENST00000229304 USP51Q70EK9 711 aa8.97□□□□□ -0.97
APOBEC1-201ENST00000229304 VTCN1Q7Z7D3 282 aa8.97□□□□□ -0.97
APOBEC1-201ENST00000229304 STK32CQ86UX6 486 aa8.97□□□□□ -0.97
APOBEC1-201ENST00000229304 LGI4Q8N135 537 aa8.97□□□□□ -0.97
APOBEC1-201ENST00000229304 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
APOBEC1-201ENST00000229304 DHRSXQ8N5I4 330 aa8.97□□□□□ -0.97
APOBEC1-201ENST00000229304 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
APOBEC1-201ENST00000229304 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa8.97□□□□□ -0.97
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC38A5Q8WUX1 472 aa8.97□□□□□ -0.97
APOBEC1-201ENST00000229304 RASSF5Q8WWW0 418 aa8.97□□□□□ -0.97
APOBEC1-201ENST00000229304 GAB3Q8WWW8 586 aa8.97□□□□□ -0.97
APOBEC1-201ENST00000229304 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
APOBEC1-201ENST00000229304 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
APOBEC1-201ENST00000229304 EDAQ92838 391 aa8.97□□□□□ -0.97
APOBEC1-201ENST00000229304 MAP3K3Q99759 626 aa8.97□□□□□ -0.97
APOBEC1-201ENST00000229304 SERHL2Q9H4I8 314 aa8.97□□□□□ -0.97
APOBEC1-201ENST00000229304 UCKL1Q9NWZ5 548 aa8.97□□□□□ -0.97
APOBEC1-201ENST00000229304 PDP2Q9P2J9 529 aa8.97□□□□□ -0.97
APOBEC1-201ENST00000229304 P2RX2Q9UBL9 471 aa8.97□□□□□ -0.97
APOBEC1-201ENST00000229304 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
APOBEC1-201ENST00000229304 AK5Q9Y6K8 562 aa8.97□□□□□ -0.97
APOBEC1-201ENST00000229304 A0A087WV62 115 aa8.96□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 ADAMDEC1O15204 470 aa8.96□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 YKT6O15498 198 aa8.96□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 LAMTOR5O43504 91 aa8.96□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 E2F6O75461 281 aa8.96□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 MFN2O95140 757 aa8.96□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 TNFAIP8O95379 198 aa8.96□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 GPR75O95800 540 aa8.96□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 AGR2O95994 175 aa8.96□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 C9P02748 559 aa8.96□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 ATP1B1P05026 303 aa8.96□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 THRBP10828 461 aa8.96□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 CPMP14384 443 aa8.96□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 ETS2P15036 469 aa8.96□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 PNLIPP16233 465 aa8.96□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 GLB1P16278 677 aa8.96□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 PORP16435 677 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 CD247P20963 164 aa8.96□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 AQP1P29972 269 aa8.96□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 PPP2R1BP30154 601 aa8.96□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 CAPGP40121 348 aa8.96□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 MAN2A2P49641 1150 aa8.96□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 ARHGDIAP52565 204 aa8.96□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 MAPK10P53779 464 aa8.96□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 CASP9P55211 416 aa8.96□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 RPS26P62854 115 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 GPLD1P80108 840 aa8.96□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 VLDLRP98155 873 aa8.96□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 BNC1Q01954 994 aa8.96□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF750Q32MQ0 723 aa8.96□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 TMEM154Q6P9G4 183 aa8.96□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 MED25Q71SY5 747 aa8.96□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa8.96□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 CA13Q8N1Q1 262 aa8.96□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 OR2L13Q8N349 312 aa8.96□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC25A45Q8N413 288 aa8.96□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa8.96□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 OR9A2Q8NGT5 310 aa8.96□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 BBS10Q8TAM1 723 aa8.96□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF675Q8TD23 568 aa8.96□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 TMEM19Q96HH6 336 aa8.96□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 CNBD2Q96M20 576 aa8.96□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF607Q96SK3 696 aa8.96□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 EPYCQ99645 322 aa8.96□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 DUSP23Q9BVJ7 150 aa8.96□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 OR51I1Q9H343 314 aa8.96□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 REEP1Q9H902 201 aa8.96□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 ANKHQ9HCJ1 492 aa8.96□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 PDE7BQ9NP56 450 aa8.96□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 PNPLA3Q9NST1 481 aa8.96□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 NDUFAF4Q9P032 175 aa8.96□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 PTGFRNQ9P2B2 879 aa8.96□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 LRIT1Q9P2V4 623 aa8.96□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 PILRBQ9UKJ0 227 aa8.96□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 RAB23Q9ULC3 237 aa8.96□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 ABCG2Q9UNQ0 655 aa8.96□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 LIPT1Q9Y234 373 aa8.96□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa8.96□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa8.96□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms