RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000079702.3

Cbx1-202, Transcript of Chromobox protein homolog 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Cbx1, Length 912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Sh3yl1O08641 340 aa11.28□□□□□ -0.6
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Cx3cl1O35188 395 aa11.28□□□□□ -0.6
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Elovl3O35949 271 aa11.28□□□□□ -0.6
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Tssk2O54863 358 aa11.28□□□□□ -0.6
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Dpm1O70152 260 aa11.28□□□□□ -0.6
Cbx1-202ENSMUST00000079702 C1ql1O88992 258 aa11.28□□□□□ -0.6
Cbx1-202ENSMUST00000079702 P01629 112 aa11.28□□□□□ -0.6
Cbx1-202ENSMUST00000079702 P01635 115 aa11.28□□□□□ -0.6
Cbx1-202ENSMUST00000079702 LtfP08071 707 aa11.28□□□□□ -0.6
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ggta1P23336 394 aa11.28□□□□□ -0.6
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Kif2aP28740 705 aa11.28□□□□□ -0.6
Cbx1-202ENSMUST00000079702 TesP47226 423 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Tra2bP62996 288 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Fgf17P63075 216 aa11.28□□□□□ -0.6
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Acss3Q14DH7 682 aa11.28□□□□□ -0.6
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Wfdc6aQ3UW55 136 aa11.28□□□□□ -0.6
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Pkp4Q68FH0 1190 aa11.28□□□□□ -0.6
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Pcdhga7Q6DD96 935 aa11.28□□□□□ -0.6
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Arhgap20Q6IFT4 1182 aa11.28□□□□□ -0.6
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ckmt2Q6P8J7 419 aa11.28□□□□□ -0.6
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Lrrc75bQ7TPD7 306 aa11.28□□□□□ -0.6
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Olfr835Q7TRG7 311 aa11.28□□□□□ -0.6
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Olfr293Q7TS10 336 aa11.28□□□□□ -0.6
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Cpsf7Q8BTV2 471 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Q8C1R3 189 aa11.28□□□□□ -0.6
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Zbtb20Q8K0L9 741 aa11.28□□□□□ -0.6
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Nudcd3Q8R1N4 363 aa11.28□□□□□ -0.6
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Olfr693Q8VF89 316 aa11.28□□□□□ -0.6
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Olfr380Q8VGT3 311 aa11.28□□□□□ -0.6
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Smim11aQ99J19 55 aa11.28□□□□□ -0.6
Cbx1-202ENSMUST00000079702 GpnmbQ99P91 574 aa11.28□□□□□ -0.6
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Q9CQ90 155 aa11.28□□□□□ -0.6
Cbx1-202ENSMUST00000079702 4930553M12RikQ9CUH1 165 aa11.28□□□□□ -0.6
Cbx1-202ENSMUST00000079702 MINDY3Q9CV28 444 aa11.28□□□□□ -0.6
Cbx1-202ENSMUST00000079702 OoepQ9CWE6 164 aa11.28□□□□□ -0.6
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Acer3Q9D099 267 aa11.28□□□□□ -0.6
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Vps33aQ9D2N9 598 aa11.28□□□□□ -0.6
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Dtwd1Q9D8U7 304 aa11.28□□□□□ -0.6
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ift22Q9DAI2 185 aa11.28□□□□□ -0.6
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Prl8a8Q9DAS4 241 aa11.28□□□□□ -0.6
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Mecp2Q9Z2D6 484 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Shank1D3YZU1 2167 aa11.28□□□□□ -0.6
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Dock10Q8BZN6 2150 aa11.28□□□□□ -0.6
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Celsr3Q91ZI0 3301 aa11.27□□□□□ -0.6
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Olfr671A0A1B0GSN5 317 aa11.27□□□□□ -0.61
Cbx1-202ENSMUST00000079702 MiipA2A7Y5 387 aa11.27□□□□□ -0.61
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Kiaa1324A2AFS3 1009 aa11.27□□□□□ -0.61
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Olfr1097A2AVA9 315 aa11.27□□□□□ -0.61
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Xlr5bA2BI50 236 aa11.27□□□□□ -0.61
Cbx1-202ENSMUST00000079702 1700122O11RikJ3QPW6 241 aa11.27□□□□□ -0.61
Cbx1-202ENSMUST00000079702 2410141K09RikK7N769 464 aa11.27□□□□□ -0.61
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Foxq1O70220 400 aa11.27□□□□□ -0.61
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Nfkbil1O88995 381 aa11.27□□□□□ -0.61
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Mtnd2P03893 345 aa11.27□□□□□ -0.61
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ctla4P09793 223 aa11.27□□□□□ -0.61
Cbx1-202ENSMUST00000079702 TfamP40630 243 aa11.27□□□□□ -0.61
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Stt3aP46978 705 aa11.27□□□□□ -0.61
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Fmo1P50285 532 aa11.27□□□□□ -0.61
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Tia1P52912 386 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Cdh26P59862 763 aa11.27□□□□□ -0.61
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Lypla1P97823 230 aa11.27□□□□□ -0.61
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Tmem64Q3U145 381 aa11.27□□□□□ -0.61
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Sel1l2Q3V172 688 aa11.27□□□□□ -0.61
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Zfp280bQ505F4 534 aa11.27□□□□□ -0.61
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ankrd37Q569N2 159 aa11.27□□□□□ -0.61
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Fzd7Q61090 572 aa11.27□□□□□ -0.61
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ly6eQ64253 130 aa11.27□□□□□ -0.61
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Lefty1Q64280 368 aa11.27□□□□□ -0.61
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Olfr1231Q7TQZ8 313 aa11.27□□□□□ -0.61
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Olfr857Q7TRF7 309 aa11.27□□□□□ -0.61
Cbx1-202ENSMUST00000079702 SybuQ8BHS8 665 aa11.27□□□□□ -0.61
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Fam177a1Q8BR63 207 aa11.27□□□□□ -0.61
Cbx1-202ENSMUST00000079702 MetrnQ8C1Q4 291 aa11.27□□□□□ -0.61
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Nadk2Q8C5H8 452 aa11.27□□□□□ -0.61
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Prmt5Q8CIG8 637 aa11.27□□□□□ -0.61
Cbx1-202ENSMUST00000079702 TbceQ8CIV8 524 aa11.27□□□□□ -0.61
Cbx1-202ENSMUST00000079702 TrhdeQ8K093 1025 aa11.27□□□□□ -0.61
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ubqln1Q8R317 582 aa11.27□□□□□ -0.61
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Efcab7Q8VDY4 628 aa11.27□□□□□ -0.61
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Chrdl2Q8VEA6 426 aa11.27□□□□□ -0.61
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Olfr77Q8VEY9 312 aa11.27□□□□□ -0.61
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Olfr849Q8VFF6 312 aa11.27□□□□□ -0.61
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Olfr649Q8VGW1 312 aa11.27□□□□□ -0.61
Cbx1-202ENSMUST00000079702 ChiaQ91XA9 473 aa11.27□□□□□ -0.61
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Vmp1Q99KU0 406 aa11.27□□□□□ -0.61
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Slc6a19Q9D687 634 aa11.27□□□□□ -0.61
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Slc38a3Q9DCP2 505 aa11.27□□□□□ -0.61
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Wwtr1Q9EPK5 395 aa11.27□□□□□ -0.61
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Spo11Q9WTK8 396 aa11.27□□□□□ -0.61
Cbx1-202ENSMUST00000079702 PrkraQ9WTX2 313 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Crlf3Q9Z2L7 442 aa11.27□□□□□ -0.61
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Prr12E9PYL2 2035 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
Cbx1-202ENSMUST00000079702 4921501E09RikA0A0R4J054 908 aa11.26□□□□□ -0.61
Cbx1-202ENSMUST00000079702 AgmatA2AS89 358 aa11.26□□□□□ -0.61
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Cd101A8E0Y8 1033 aa11.26□□□□□ -0.61
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Olfr740E9PV79 311 aa11.26□□□□□ -0.61
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Vmn2r92L7N2A4 860 aa11.26□□□□□ -0.61
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Pip5k1cO70161 661 aa11.26□□□□□ -0.61
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Zfp14P10755 501 aa11.26□□□□□ -0.61
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Klk1b11P15946 261 aa11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 52.3 ms