RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 GRM8O00222 908 aa28.15■■■□□ 2.1
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CAPNS1-212ENST00000591041 CHD1LQ86WJ1 897 aa28.15■■■□□ 2.1
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CAPNS1-212ENST00000591041 RREB1Q92766 1687 aa27.93■■■□□ 2.06
CAPNS1-212ENST00000591041 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP27.92■■■□□ 2.061e-7■■■■■ 27.3
CAPNS1-212ENST00000591041 BMP2KLQ5H9B9 411 aa27.92■■■□□ 2.06
CAPNS1-212ENST00000591041 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
CAPNS1-212ENST00000591041 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa27.92■■■□□ 2.06
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