RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590367.5

EFTUD2-218, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 3,638 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-218ENST00000590367 CCDC61Q9Y6R9 512 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 SLFNL1Q499Z3 407 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 KIAA1524Q8TCG1 905 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 H0YHG0 523 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 USP8P40818 1118 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 SARNPP82979 210 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 MCTP2Q6DN12 878 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 CFAP44Q96MT7 982 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 BTG4Q9NY30 223 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 POLKQ9UBT6 870 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 PRR36Q9H6K5 1346 aa9.21□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 UNC5CLQ8IV45 518 aa9.21□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 RUNDC1Q96C34 613 aa9.21□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 IVLP07476 585 aa9.21□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 PPM1EQ8WY54 764 aa9.21□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 KIF1BPQ96EK5 621 aa9.21□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 IRF6O14896 467 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 ADCY5O95622 1261 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 MAGEA9P43362 315 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 ZSCAN26Q16670 478 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 CASC1Q6TDU7 716 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 PANK1Q8TE04 598 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 ACEP12821 1306 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 TECPR2O15040 1411 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 GOLGA5Q8TBA6 731 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 CABP1Q9NZU7 370 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 NLRP6P59044 892 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 SRLQ86TD4 932 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 FAM53CQ9NYF3 392 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 PPLO60437 1756 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 MYOM2P54296 1465 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 FAM83GA6ND36 823 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 GYS2P54840 703 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 SGSM3Q96HU1 749 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 CEP89Q96ST8 783 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 ARHGEF10O15013 1369 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 GSCP56915 257 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 LEKR1Q6ZMV7 388 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 USP25Q9UHP3 1055 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 NALCNQ8IZF0 1738 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 SEPT12Q8IYM1 358 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 BIRC2Q13490 618 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 PPP2R5AQ15172 486 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 FAM182BQ5T319 152 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 ERO1AQ96HE7 468 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 TRIM66O15016 1216 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 SART3Q15020 963 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 TMEM63CQ9P1W3 806 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 TPRNQ4KMQ1 711 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 OTUD6BQ8N6M0 293 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 JMYQ8N9B5 988 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 FAM210AQ96ND0 272 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 NBPF3Q9H094 633 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 TPM1P09493 284 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 ANAPC15P60006 121 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 MPNDQ8N594 471 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 NEK11Q8NG66 645 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 TNS3Q68CZ2 1445 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 PLCB2Q00722 1185 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 IFT57Q9NWB7 429 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 KMT5BQ4FZB7 885 aa9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 GPT2Q8TD30 523 aa9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 GAS2L2Q8NHY3 880 aa9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 GIMAP7Q8NHV1 300 aa9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 DNAAF4Q8WXU2 420 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 ZNF446Q9NWS9 450 aa9.15□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.2 ms